ارزیابی بیوانفورماتیکی مسیرهای سیگنالی تارگتوم hsa-miR-3934 و عملکرد SNP مرتبط با آن(rs2976394) در افراد مبتلا به سرطان معده

در سال های اخیرسرطان معده دومین علت مرگ و میر در اثر سرطان به شمار می رودکه علاوه بر هزینه های قابل توجه، مشکلات عدیده ای را بر خانواده ها تحمیل نموده و خود توجیه مناسبی جهت شناسایی بیومارکرهای مرتبط می باشد.. بدین علت برای یافتن اطلاعات بیوانفورماتیکی یشتر در این رابطه سایت های NCBI، miRNASNP، miRBase، phenomiR ، miRWALK2.0 و DAVID مورد استفاده قرار گرفت. مطالعات انجام شده در سایت های NCBIبیانگر آن است که یکی از ژن های درگیر با این بیماری ژن PSCA در جایگاه کروموزومی 8q24.2 می باشد. در این ارتباط به منظور شناسایی میکرو RNAهای مرتبط با آن از پایگاههای داده miRNASNP و miRdSNP استفاده شد. بررسی ها در جایگاه rs2976394 مشخص ساخت که آلل C به T تبدیل میشود، که ممکن است براتصال و عملکرد میکرو RNAهای مرتبط با این ناحیه اثر بگذارد. در نهایت hsa-miR-3934 به عنوان یکی از مهمترین میکرو RNAهای مرتبط با این ژن مشخص شده و با توجه به تایید نقش hsa-miR-3934 در سرطان معده از طریق پایگاههای داده بیوانفورماتیکی از جمله phenomiR، بدست آوردن ژن های هدف آن از طریق پایگاه داده miRWALK2.0 و ارزیابی مسیرهای سیگنالی مرتبط با آن با استفاده از پایگاه داده DAVID، این میکرو RNA به منظور آنالیزهای بعدی انتخاب گردید

کلیدواژه ها:

سرطان معده ، بیوانفورماتیک ، ژن PSCA ، میکروRNA(has-miR-3934) ، چندریختی تک نوکلیوتیدی rs2976394