آنالیر عوامل رونویسی و پیش بینی مولفه های ساختاری ژن های سازنده آنزیم امگا 6 فتی اسید دی سچوراز

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,223

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AGRIBIOTECH03_080

تاریخ نمایه سازی: 27 تیر 1392

چکیده مقاله:

آنزیم امگا 6 فتی اسید ، آنزیمی دی سچوراز و غیر اشباع کننده است که باعث اضافه شدن دومین پیوند دوگانه به زنجیره اسید چرب 20 کربنه ی امگا 3 و امگا 6 می شود. مهمترین ماتریکس ها و خانواده های فاکتورهای رونویسی توسط ابزار های بیوانفورماتیکی که در رونویسی ژن Omega-6 Fatty Acid Desaturase FAD6 نقش دارند نیز تعیین شد . و فاکتورهای رونویسی جهت پیدا کردن کاندیدی احتمالی که تا به حال در مقاله ای ثبت نشده باشد جستجو شد. با استفاده از ابزارهای مدل سازی و برنامه های مختلف داده کاوی نسبت به طراحی بانک اطلاعاتی از متغیرهای ژنی حدود 110 فستای ژنی آنزیمهای فوق در گونه های مختلف اقدام شده و سپس با استفاده از مدلهای وزن دهی، درخت های تصمیم گیری و روشهای دسته بندی نسبت به شناسایی مهمترین متغیرها اقدام شد. در نهایت برای اولین بار طراحی مدل های پیش بینی نوع ارگانیزم بر اساس متغیرهای ژنی انجام شد.سپس با استفاده از دیتا بیس های ژنی تحت وب ، حدود 110 ژنی که سازنده ی آنزیم استریول کو آنزیم آ در تمام موجودات است ، جمع آوری شد و با استفاده از مدل های پیش بینی وب سایت های ژنتیکی ، فاکتورهای رونویسی که بیشترین شباهت را با پروموتر ژن های سازنده ی این آنزیم داشتند پیش بینی شدند و بر اساس نوع ماتریکس و خانواده ی فاکتور های رونویسی دسته بندی شدند مهمترین متغیر ژنی در تشخیص ساختارهای ارگانیزمی آنزیم FAD6 مولفه ی تعداد نوکلئوتید های گوانین و تیمین که به ترتیب به هم متصل اند GT بوده است. همچنین مدلهای پیش بینی طراحی شده نشان دادند که مدل شبکه ی عصبی Neural Net با دقت 97.75% می تواند ارگانیزم آنزیمهای جدید را بر اساس خصوصیات ژنی پیش بینی نماید.

کلیدواژه ها:

Omega-6 Fatty Acid Desaturase ، امگا 6 فتی اسید دی سچوراز ، FAD6 ، . امگا 3 و امگا

نویسندگان

مرتضی رضوی

کارشناس زیست شناسی دانشگاه پیام نور

علی سالاری

دانشجوی کارشناسی زیست شناسی دانشگاه پیام نور قم

حسین موسوی

کارشناس زیست شناسی دانشگاه پیام نور قم

منصور ابراهیمی

گروه پژوهشی بیوانفورماتیک، پژوهشکده سبز دانشگاه قم

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • .1 Simopoulos, A.P., Omega-3 fatty acids in health and disease ...
  • .2 Allayee, H., N. Roth, and H.N. Hodis, Polyunsa turated ...
  • .3 Dobrzyn, A. and P. Dobrzyn, Stearoyl-CoA desaturase--a new player ...
  • .4 Habashy, H.O., et al., RERG (Ras-like, oes trogen-regula ted, ...
  • .5 Chen, B., et al., Bayesian inference of the number ...
  • .6 Rapin, N., et al., Computational immunology meets bioinformatics: the ...
  • نمایش کامل مراجع