آنالیز فیلوژنتیکی ژن Cylindrical Inclusion ویروس موزائیک زرد کدو جدایه استان مازندران
محل انتشار: اولین کنگره ملی زیست شناسی و علوم طبیعی ایران
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,101
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
BSCONF01_125
تاریخ نمایه سازی: 15 بهمن 1393
چکیده مقاله:
ویروس موزائیک زرد کدو Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) از جنس پوتی ویروس یکی از عوامل مهم محدود کننده محصولات کدوئیان در ایران میباشد. ناحیه Cylindrical Inclusion (CI) این ویروس که مختص به پوتی ویروسها است، نقش بسزایی در رونویسی ویروس و حرکت سلول به سلول دارد. در ابتدا از مناطق مختلف جالیزکاریهای شهر ساری در استان مازندران نمونه برداری صورت گرفت، سپس آلودگی نمونه ها به ویروس با انجام تست الایزا تایید شد. به منظور بررسیهای مولکولی، استخراج آر ان ای انجام شد وبه دنبال آن، cDNA ی ویروس با تکنیک RT-PCR ساخته شد. ناحیه مورد نظر جدایه نماینده به وسیله جفت آغازگرهای اختصاصی (CIFor و CIRev) به وسیله واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) تکثیر شد. پس از تعیین توالی و همردیف سازی نوکلئوتیدها، این توالی با استفاده از برنامه بلاست با دیگر توالیهای موجود در بانک ژن مقایسه گردید. بررسی ارتباط فیلوژنتیکی این جدایه با دیگر جدایه ها و ترسیم درخت فیلوژنتیکی با برنامه MEGA موید بیشترین شباهت این جدایه با جدایه Gj1 از استان خراسان، هم از لحاظ ترادف نوکلئوتیدی و هم آمینو اسیدی بود. این اولین بررسی و تعیین ترادف ناحیه CI از ژنوم ویروس موزائیک زرد کدو جدایه استان مازندران میباشد..
کلیدواژه ها:
نویسندگان
حسینعلی میرحسینی
دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
حشمت اله رحیمیان
استاد گروه بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
ولی اله بابایی زاد
استاد یار گروه بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سحر نوری
دانشجوی دکتری بیماری شناسی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :