جداسازی، مشخصه یابی بیوشیمیایی و شناسایی مولکولی اکتینومیست ها و استرپتومیست های بومی رسوبات سواحل شمالی خلیج فارس

مقدمه: رسوبات دریایی خلیج فارس به دلیل شرایط اکولوژیکی منحصربه فرد، منبعی بالقوه برای کشف میکروارگانیسم های تولیدکننده متابولیت های ثانویه ارزشمند محسوب می شوند. هدف از این پژوهش، جداسازی، شناسایی بیوشیمیایی و تایید مولکولی اکتینومیست ها و استرپتومیست های بومی رسوبات سواحل شمالی خلیج فارس بود. روش کار: نمونه های رسوبی از سه ایستگاه در سواحل شمالی خلیج فارس (خوزستان، بوشهر و هرمزگان) از اعماق ۱.۵ تا ۵ متری جمع آوری شدند. پس از پیش تیمار حرارتی (°C ۶۵ به مدت ۱۵ دقیقه) و رقت سازی سریالی، نمونه ها روی محیط های انتخابی استارچ کازئین آگار (SCA) و گلیسرول کازئین آگار کشت داده شدند. شناسایی اولیه بر اساس ویژگی های مورفولوژیکی و تست های بیوشیمیایی انجام گرفت و تایید نهایی از طریق تکثیر و توالی یابی ژن ۱۶S rRNA صورت پذیرفت. آنالیز فیلوژنتیک با استفاده از نرم افزار MEGA v۷ و الگوریتم Neighbor-Joining انجام شد. بحث و نتیجه گیری: سه جدایه باکتریایی شامل دو سویه اکتینومیست و یک سویه استرپتومیست با موفقیت جداسازی شدند. استرپتومیست جداسازی شده دارای ویژگی های متمایزی شامل مقاومت به لیزوزیم و پنی سیلین، و تولید رنگدانه های محلول در آب بود. توالی های ژن ۱۶S rRNA با شماره های دسترسی PP۹۱۵۹۹۷ (Actinomycetales bacterium strain Nazek۲)، PP۹۱۹۱۶۳ (Actinomycetes bacterium strain Nazek۳) و PP۹۱۱۵۹۱ (Streptomyces sp. strain Nazek۱) در پایگاه داده NCBI ثبت شدند. رسوبات دریایی خلیج فارس منبعی غنی و کمتر کاوش شده برای تنوع زیستی اکتینومیست ها هستند. سویه های ثبت شده در این پژوهش، پایه ای ارزشمند برای مطالعات آتی ژنومیک و کشف ترکیبات دارویی نوین از منابع طبیعی دریایی ایران فراهم می آورند.

کلیدواژه ها:

اکتینومیست ، استرپتومیست ، رسوبات دریایی ، خلیج فارس ، ژن ۱۶S rRNA ، تنوع زیستی میکروبی