بررسی ژن ها و مسیرهای کلیدی در سرطان معده با رویکرد بیوانفورماتیک

سرطان معده یکی از شایع ترین و کشنده ترین سرطان ها در سراسر جهان است. شناسایی ژن های کلیدی و مسیرهای مولکولی مرتبط با این بیماری می تواند به بهبود روش های تشخیص و درمان آن کمک کند. در این مطالعه، به منظور بررسی تغییرات بیان ژنی در سرطان معده، پروفایل بیان ژن GSE۶۶۲۲۹ از پایگاه داده Gene Expression Omnibus (GEO) دانلود و تحلیل شد. در مجموع، ۶۳۶ ژن دارای بیان متفاوت (DEGs) شناسایی شد که شامل ۲۰۳ ژن با بیان افزایشی و ۴۳۱ ژن با بیان کاهشی بود. تجزیه و تحلیل غنی سازی عملکردی ژن ها با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی DAVID و KEGG. انجام شد ۵ مسیر برتر از نظر ارتباط با سرطان معده شامل مسیر ترشح اسید معده، مسیر سیگنالینگ p۵۳، آرتریت روماتوئید، چرخه سلولی، و تعامل سیتوکین-گیرنده سیتوکین شناسایی شدند. به منظور بررسی تعاملات پروتئین-پروتئین، شبکه PPI با استفاده از پایگاه داده STRING ساخته شد و تحلیل شبکه با نرم افزار Cytoscape. صورت گرفت ۵ ژن کلیدی با نقش هاب شامل CDK۱، CCNA۲، CCNB۱، BUB۱B، PBK شناسایی شدند که به عنوان اهداف بالقوه برای تحقیقات بیشتر و توسعه درمان های هدفمند در سرطان معده معرفی گردیدند. یافته های این مطالعه می تواند درک بهتری از مکانیسم های مولکولی سرطان معده ارائه دهد و به توسعه روش های جدید درمانی کمک کند.

کلیدواژه ها:

سرطان معده ، ژن های کلیدی ، مکانیسم های مولکولی ، بیان ژن ، بیوانفورماتیک