مقایسه نرم افزارهای Autodock4.2 ،Autodock Vina،ChemBioOffice Ultra و Arguslab4.0 در فرایند چفت ملکولی (Molecular Docking)

شاید بتوان گفت که از میان علوم بین رشته ایی، بررسی چفت مولکولی بلافاصله با کاربرد عملی همراه است. به عبارتی دیگر در این علم، بیشتر نظری ههای علوم زیستی، شیمیایی، فیزیکی ، کوانتومی و ترمودینامیکی دست در دست هم می دهند تا مدل سازی و طراحی مولکولهای زیستی برای یک مجموع آنزیمی از یک فرایند زیستی-آنزیمی را انجام دهند. جهت انجام این عمل، نر مافزارهای زیادی توسعه یافته اند که اساس کار آنها کمینه کردن انرژی آزاد گیبس در غالب الگوریتمهای متفاوت است. در این مطالعه نرم افزارهای Arguslab و 4.0 Autodock4,2 ،Autodock Vina ،ChemBioOffice برای بررسی یکی از لیگاندهای که در سولفوکسید های γ گلوتامیل S- آلیل L- سیستئین گرو هبندی می شود، استفاده شد . نتایج نشان داد که عملکرد نرم افزار Aoutodock Vina به نسبت بهتر از سایر نرم افزارهای ارایه شده بود. لذا پیشنهاد م یشود که از این نرم افزار در مطالعات چفت ملکولی استفاده گردد Autodock Vina یک برنامه جدید است که برای کشف دارو ، چفت مولکولی و آزمایش مجازی ، ارائه شده است Autodock Vina به طور خود کار نقشه ی شبکه را محاسبه می کند و نتایج را به طور واضح برای کاربر دسته بندی می کند.

کلیدواژه ها:

چفت ملکولی ، لیگاند ، نرم افزارهای Autodock4 ، 2 ، Autodock Vina ، ChemBioOffice Ultra و Arguslab 4.0