بررسی آنالیز بیوانفورماتیکی ژن های انتقالی به گیاهان در ایران ‭(cry1Ab, cry3, cry1Ac, chitinas, glucanase, PR1) ‬به منظور بررسی ایمنی آنها

اگر چه در انتهای سال ‮‭2010‬ سطح زیر کشت گیاهان تراریخته به بیش از ‮‭130‬ میلیون هکتار رسید، ولی یکی از نگرانی های ابراز شده ریسک های ناشی از این گونه محصولات می باشد. به منظورآنالیز ریسک ناشی از محصولات تراریخته قوانین و استاندارد های وجود دارد تا بتوان بوسیله انها ایمنی محصولات تراریخته را تضمین کرد . یکی از راهکارهایی که ارایه گردیده، ارزیابی پروتیین های بیان شده حاصل از ژن هایی که به گیاهان تراریخته وارد شده با استفاده از ابزار های بیوانفورماتیکی است. در این مطالعه پروتیین های ‭Glucanase Cry‬،3 ‭CryIAb‬، ‭Cry‬1‭Ac‬، ‭Chitinase‬، و‭PR‬1 که به منظور تولید گیاهان تراریخته در کشور استفاده شده با استفاده از پایگاه های آلرژن ‭Allermatch ‬، ‭ALLERDB ‬،‭ADFS ‬،‭FARRP ‬و ‭SDAP ‬با 3 روش پنجره های ‮‭80‬ آمینو اسیدی و 6 یا 8 اسید آمینه پیوسته یکسان بر طبق قوانین ‭FAO-WHO ‬مورد بررسی شد و همچنین از روش سوم که همردیفی کامل است نیز استفاده گردید. پروتیین های که آلرژی زایی را نشان می دادند، هضم آنزیمی در شرایط ‭In silico ‬با استفاده از ‭Peptide Cutter ‬و ‭PeptideMas ‬روی آنها صورت گرفت. سپس توالی کامل این پروتیین ها و قطعات هضم شده دارای توالی 8 اسید آمینه ای یکسان بهم پیوسته آلرژن نیز برای بررسی پتانسیل اپی توپی با نرم افزار پیش بینی پتانسیل اپی توپی صورت گرفت. ژن های ‭cryIII‬، ‭cryIAb‬، ‭cryIAc ‬هیچ نوع تشابه معنی داری با پروتیین های آلرژن نداشتند. بررسی آلرژی زایی پروتیین ‭PR‬1، کیتیناز و گلوکاناز که منشا گیاهی دارند نشان داد که در تعدادی از بانک های آلرژن احتمال آلرژی زا ی وجود دارد. بررسی پتانسیل اپی توپی در مورد پروتیین ‭PR‬1 و گلوکاناز هیچ نوع پتانسیل اتصال به ‭IgE ‬نشان ندادند اما در مورد پروتیین کیتیناز در ناحیه ‭SQWGWC ‬پتانسیل اتصال به میزان کمی به ‭IgE ‬مشاهده شد. واژه های کلیدی: آلرژن، ایمنی زیستی، بیوانفورماتیک، پایگاه-های اطلاعاتی