بررسی راهکار تلفیقی برای افزایش مقاومت لایم به جاروی جادوگر: بررسی اثر متقابل میزبان- پاتوژن در گیاه لیموترش آلوده به فایتوپلاسمای عامل بیماری جاروک لیموترش ‭(Candidatus Phytoplasma aurantifolia)‬

فایتوپلاسمای ‭Candidatus Phytoplasma aurantifolia ‬عامل بیماری جاروک لیموترش یک پاتوژن اجباری و محدود به بافت آبکش میصباشد. با توجه به وجود اطلاعات اندک در مورد اساس مولکولی سازگاری این پاتوژن با میزبان و چگونگی گسترش بیماری، در این بررسی از روش ‭cDNA-AFLP ‬برای تعیین ژن های دخیل در برهمکنش‭Candidatus Phytoplasma aurantifolia ‬و لیموترش در بیماری جاروک استفاده شد. دو جفت ترکیب آنزیمی ‭MseI/EcoRI ‬و ‭MseI/PSuI ‬برای مرحله برش آنزیمی و ‮‭43‬ ترکیب پرایمری برای تکثیر ‭cDNA‬های هضم شده با آنزیم های مذکور استفاده شد. در مجموع ‮‭51‬ قطعه از نسخه های ژنی که بیان متفاوتی در همه تکرارهای دو تیمار داشتند به دست آمد. توالی ‮‭36‬ قطعه با ژن های موجود در بانک های اطلاعاتی شباهت داشت. ‮‭15‬توالی دیگر جزو نسخه هایی بودند که هیچ شباهتی با توالی های موجود نداشتند و احتمال داده می شود که مربوط به ژن های فایتوپلاسمایی، مقاومت میزبان و یا بیماریزایی باشند. بیان حدود %‮‭67‬ از نسخهصهای ژن های مورد مطالعه نظیر ژن های ‭snc‬1 و 5 ‭autophagy‬در طی آلودگی کاهش داشت. بیان دیگر ژنصهای مهم چون ژن های کدکننده پروتیینصهای ‭formin‬، ‭importin beta ‬3، ‭L-asparaginase‬،‭glycerophosphoryl diester phosphodiesterase ‬و ‭RNA polymerase beta ‬نیز در اثر آلودگی فایتوپلاسمایی روند کاهش را نشان می داد. برعکس بیان ژن های کدکننده پروتیین های ‭ubiquitin-protein ligase‬، پروتیین غنی از پرولین، ‭phosphatidyl glycerol specific phospholipase C-like ‬و ‭serine/threonine-protein kinase ‬در طول چرخه بیماری رو به افزایش گذاشت. در طی این بررسی ها، فهرستی از ژن های کاندید که احتمالا در برهمکنش لیموترش با فایتوپلاسمای ‭Candidatus Phytoplasma aurantifolia ‬دخالت دارند معرفی شدند که از دو جنبه افزایش اطلاعات مولکولی مربوط به روند بیماری و نیز شناسایی ژن هایی که در واکنش گیاه به پاتوژن بیان شان تغییر می کند و یا به عبارتی منجر به بروز واکنش سازگار (بیماری) می شوند، حایز اهمیت هستند. با تعیین این ژن ها می توان فاکتورهای ناسازگاری (مقاومت) را با توجه به ژن های میزبانی که در طی چرخه آلودگی بیان شان تغییر نموده است را نیز تعیین نمود. واژه های کلیدی لیموترش، ‭Candidatus Phytoplasma aurantifolia‬، جاروک لیموترش، ‭cDNA-AFLP .