تعیین مناسب ترین روش تشخیص و ردیابی عامل بیماری باکتریایی آتشک درختان میوه دانه دار ‭(Erwinia amylovora) ‬در درختان مادری و نهالستان ها

بیماری آتشک با عامل ‭Erwinia amylovora ‬یکی از مهمترین و مخربترین بیماری های خانواده گل سرخیان است. روش هایی که با سرعت و حساسیت زیاد پاتوژن را ردیابی می کنند ابزار مهمی در کنترل بیماری هستند. در این تحقیق حساسیت و دقت چهار روش تشخیصی کشت روی محیط نیمه انتخابی، روش ‭Lateral Flow Immuno Chromatography (LFIC)‬، ‭Polymerase Chain Reaction (PCR) ‬و ‭PCR ‬آشیانه ای به همراه غنی سازی و بدون غنی سازی در ردیابی این باکتری مقایسه و ارزیابی گردید. بر اساس نتایج روش کشت انتخابی روی محیط ‭CCT ‬تا ‭CFU/ml‬1 باکتری ‭E. amylovora ‬را از عصاره گیاه آلوده تشخیص داد اما قادر به ردیابی آلودگی پنهان نبود. با استفاده از پیش غنی سازی تشخیص و ردیابی دقیق تر باکتری روی محیط کشت نیمه انتخابی ‭CCT ‬در آلودگی های پنهان امکانپذیر شد. روش‭Lateral flow immunochromatography ‬غلظت ‮‭105‬ ‭CFU/ml ‬باکتری در عصاره گیاه آلوده را شناسایی نمود، اما پس از غنی سازی علاوه بر توان ردیابی باکتری در شرایط آلودگی پنهان، دقت تشخیص این آزمون صد هزار برابر یعنی تا 1 ‭CFU/ml ‬افزایش پیدا کرد. روش ‭PCR ‬معمول و ‭PCR ‬آشیانه ای با استفاده از آغازگرهای اختصاصی با موفقیت قادر به ردیابی آلودگی پنهان و جمعیت های پایین باکتری در حد ‭CFU/ml‬1 باکتری در عصاره گیاهی با غنی سازی و بدون غنی سازی گردید و پیش غنی سازی تاثیری در افزایش دقت آن نداشت. کلید واژه‭: Erwinia amylovora‬، ردیابی، ‭PCR‬، پیش غنی سازی، ‭LFIC