ویژگی های مولکولی برخی جدایه های ایرانی ویروس لکه سبزرد سیب با تاکید بر معرفی یک سیستم تشخیص مولکولی برای آن

ویروس لکه سبزرد سیب‭(Apple chlorotic leaf spot virus‬، ‭ACLSV) ‬یکی از ویروس های مهم درختان میوه محسوب می شود. مطالعات مقدماتی بر اساس آزمون سرولوژیک الیزا وجود این ویروس را در ایران نشان داده است با اینحال در ایران تشخیص مولکولی این ویروس صورت نگرفته است. در این تحقیق روش تشخیص مولکولی بدون استفاده از کیت استخراج ‭RNA ‬بهینه سازی شد. به این منظور از باغات سیب استان های تهران، آذربایجان غربی، آذربایجان شرقی و اصفهان بازدید و نمونه برداری بعمل آمد.آلودگی برخی نمونه ها به روش الیزا و انتقال مکانیکی به گیاه ‭Chenopodium amaranticolor ‬تایید و جهت بهینه سازی روش تشخیص مولکولی ویروس لکه سبزرد سیب مورد استفاده قرار گرفت. بهینه سازی روش تشخیص مولکولی با استفاده از ‭RNA ‬استخراج شده به روش روحانی و همکاران و جفت آغازگرهای طراحی شده برای تکثیر قطعه ‮‭385‬ نوکلیوتیدی مربوط به بخشی از ژن پروتیین پوششی ‭ACLSV ‬صورت گرفت. در این تحقیق از ترادف نوکلیوتیدی بخشی از ‮‭33‬ ‭CP ‬جدایه ویروس لکه سبزرد سیب از جمله یک جدایه از ایران جهت آنالیز فیلوژنتیکی جدایه ایرانی و مقایسه با جدایه های سایر مناطق جهان استفاده شد.آنالیز ترادف جدایه ها و درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده بر اساس ناحیه ‭CP ‬و به روش نزدیک ترین همسایه ‭(neighbor joining) ‬نشان داد که جدایه های ‭ACLSV ‬در دو گروه ‭A (‬شامل دو زیر گروه ‭I ‬و‭II) ‬و‭B ‬قرار می گیرند و جدایه ایرانی ‭ACLSV ‬در زیرگروه ‭I ‬از گروه ‭A ‬قرار می گیرد . درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده بر اساس بخشی از توالی ‭CP ‬نشان داد که هیچ رابطه ای بین منشا جغرافیایی و میزبان ویروس وجود ندارد. برای تعیین جایگاه دقیق جدایه های ایرانی ‭ACLSV ‬تعیین توالی طول کامل ‭CP ‬تعداد بیشتری از جدایه ها از میزبان ها و مناطق مختلف ضروری می باشد. لغات کلیدی: ویروس لکه سبزرد سیب، سیب، تشخیص مولکولی