انتشار مقالات چهارمین کنفرانس زیست شناسی سامانه های ایران

سه شنبه، 20 مهر، 1400
انتشار مقالات چهارمین کنفرانس زیست شناسی سامانه های ایران
مقالات چهارمین کنفرانس زیست شناسی سامانه های ایران در تاریخ 20 مهر 1400 در پایگاه سیویلیکا نمایه و منتشر شد.این رویداد توسط پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری و پژوهشگاه ملي مهندسي ژنتيك و زيست فناوري در شهر تهران برگزار شده است.در این رویداد 68 مقاله شامل 225 صفحه ارائه شده است.بر اساس تحلیل اولیه انجام شده، مقالات این دوره از کنفرانس عمدتا در موضوعات زیر ارائه شده است:
  • - زیست شناسی عمومی
لیست و عناوین مقالات نمایه شده از چهارمین کنفرانس زیست شناسی سامانه های ایران به صورت زیر می باشد:

1. The trace of metabolites in progression of diabetes mellitus


2. Selection of the best growth kinetic model of Penicillium brevicompactum through a new reconstructed genome scale metabolic model


3. Transcriptome Analysis of candidate genes associated with defense responses to drought Stress in Wheat (Triticum aestivum L.) Root


4. Introducing in silico based strategies for modeling and predicting proteinprotein interactions involved in anticancer mechanisms of actions of metformin against thyroid carcinoma


5. Identification of Celecoxib targeted proteins using thermal proteome profiling on rat hippocampus


6. System Biology Approach for Drug Repositioning Against Parkinson's Disease


7. Exploring hub genes in hepatocellular carcinoma using a systems biology approach


8. Integrative systems biology approach prioritizes geldanamycin-HSP۹۰AB۱ as a common drug-target candidate in type ۱ diabetes and multiple sclerosis


9. شناسایی ژن های کلیدی موثر بر کیفیت نانوایی دو رقم گندم نان ایرانی در ۵ روز بعد ازگرده افشانی براساس مطالعه شبکه میان کنش پروتئین-پروتئین


10. A network-based approach to drug repositioning and its applications


11. An R package for quality control of genome-wide association study results


12. Improving Biological Activity Prediction Using Recursive Clustering Algorithm


13. Which one will be more applicable in the future of ligand based in computational drug design studies: neural network or deep learning?


14. Deep neural network in QSAR studies using deep belief network


15. Medndelian randomization analyses refer to a protective role for VLDL concentration against type ۲ diabetes


16. Multi-omics approaches reveal new targets and mediating mechanisms for blood pressure


17. Prioritization and follow up of primary open-angle glaucoma associated genes


18. Genomic instruments help to find Driver nodes in co-expression networks


19. بررسی و ارائه نشانگرهای زیستی جهت شناسایی پیشروی بیماری هپاتیت B به سمت کارسینوم سلولهای کبدی با رویکرد زیست شناسی سامانه ای


20. Secondary metabolite genome annotation for a new Nonomuraea sp.


21. شناسایی بیوانفورماتیکی سیگنال پپتید موثربرای بیان پری پلاسمیک فاکتور رشد انسانی در E. coli


22. Stratified genome-wide association analysis of blood pressure traits reveal new specific loci for systolic and diastolic blood pressures


23. A Robust Fuzzy-logic-based Analysis of the Stochastic Dynamics of a Genetic Toggle Switch in the Presence of Uncertainty


24. Identification of Key Proteins in different stages of Hepatocellular carcinoma (HCC) compared to Normal Liver tissue with a Systems Biology approach


25. Development of a General Algorithm to Identify n-Tuple Synthetic Lethal Reactions in Genome-Scale Models: A Systematic Approach Based on Fast-SL


26. Decoding linagliptin protective effects on kidney and cardio by investigating its transcription factors (TFs)-micro RNAs -target genes regulatory network


27. Investigation of expression IL۶ST in Asthenozoospermic men using microarray and RNAseq Meta-analysis Data


28. A systematic approach revealed hub genes and signaling pathways in EGFRTKI-resistance small-cell lung cancer (SCLC)


29. Identification of Genes and Pathways in Colorectal Cancer and the Potential Role of Probiotics on its Prevention


30. A Framework for Improving the Predictive Model of Breast Cancer Recurrence


31. The spectrum of macrophages phenotypes could be determined by PPInetwork and transcription f actor enrichment analysis


32. Bifurcation analysis reveals mechanisms of macrophage polarization


33. Cisplatin-resistant cancer cells proceed in to a polyploidy state through activation of a network of signaling pathways


34. بررسی تاثیر عصاره های گیاهان دارویی بر بیان ژن ها در سلول های سرطانی با استفاده از روش فراتحلیل


35. شناسایی نواحی ویرایش RNA در بیماران مبتلا به سرطان معده با استفاده از داده های توالی یابی RNA


36. شناسایی PTKهای هم بیان با ژن ADAR از طریق داده کاوی پروفایل بیان ژن در بیماران مبتلا به سرطان معده


37. Dynamic genome-scale metabolic modeling of Pichia pastoris by integrating transcriptomics using TRFBA algorithm


38. شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با مقاومت به نژادهای مختلف فوزاریوم در نخود با استفاده از آنالیز Meta-QTL


39. Prediction of gene ontology by deep learning


40. Systems-Oriented Strategy for Succinic Acid Production in E. coli


41. Detection hub genes involving in celiac disease


42. Microalgae Metabolic Modelling: Formulation, Analyses, Applications, and Challenges


43. Perdition of Smoking in Young Adults Based on Machine Learning Methods:A System Medicine Approach


44. یافتن miRNA های جدید مرتبط با بیماری آلزایمر با استفاده از پایگاه داده های بیوانفورماتیک


45. ۲-hpp production by the yeast saccharomyces cerevisiae


46. بررسی پروفایل بیان ژنی تومورهای سرطان سینه متاستاز شده به ریه جهت شناسایی شبکه پروتئینی با استفاده از روش های سیستم بیولوژی


47. Identification and Control of Bacillus thuringiensis Batch Bioreactor Using Neural Network Approach


48. Integration of Transcriptome and Proteome Datasets for Finding Novel Biomarkers in Acute Lymphoblastic Leukemia


49. Deciphering the transcription factor-microRNA-target gene regulatory network associated with Endometriosis ,and Identification of core genes of Endometriosis using PPI analysis


50. بررسی اهمیت پارامترهای مدل برای شبکه متابولیک تنظیمی در باکتری اشریشیا کلی


51. مروری بر کاربرد سیستم CRISPR/Cas۹ در کاهش انکوژن زایی سرطان تیروئید آناپلاستیک


52. واکاوی پروتئوم و ژنوم گونه های لاکتوباسیل و بیفیدوباکتر جهت بررسی باکتریوسین ها و مقابله با باکتریهای پاتوژن


53. Identification of core genes and outcomes related to the effect of Crizotinib on gastric cancer using bioinformatics analysis


54. In Silico Selection of an Optimal Signal Peptide for Improve Expression and Secretion of Human Interferon Alpha ۲b (IFN-۲b) in E. coli


55. مقایسه توالی ژن لیمونن سنتاز گونه های جنس نعنا (Mentha spp.)


56. Transcriptomic analysis of MCF-۷ cells treated in acidosis


57. آنالیز ترنسکریپتومی کارسینوم هپاتوسلولار جهت تشخیص ژن های کلیدی در این بیماری


58. بهبود تولید هیالورونیکاسید با روش مبتنی بر زیست شناسی سامانه ها


59. Gut-brain axis dysfunction in Autism Spectrum Disorder Affected by Microbiota & Metabolic Network


60. Bio-based succinic acid and systems metabolic engineering, a brief review


61. Metabolic Pathway Engineering of Chlamydomonas reinhardtii Microalgae to Increase Hydrogen Production


62. Using possibilistic clustering method in microarray dataset of Alzheimer


63. In silico analysis to predict involving pathways of transcribed ultraconserved regions (T-UCRs) in the bladder cancer


64. Genome-scale Constraint-based Metabolic Modelling of Propionibacterium freudenreichii


65. Genome-Scale Tissue-specific Reconstruction and Analysis of Metabolic Network in Glioblastoma multiform and Glioblastoma Stem Cells for Identification of Novel Anti-Brain Tumor Drug Targets


66. Critical assessment of genome-scale metabolic Models of Arabidopsis thaliana


67. تشخیص بیماری اوتیسم با استفاده از netDX و تصاویر تشدید مغناطیسی عملکردی


68. شناسایی ژن های دخیل در تحمل به تنش شوری برنج با استفاده از رویکرد متاآنالیز