شناسایی ژن های دخیل در تحمل به تنش شوری برنج با استفاده از رویکرد متاآنالیز

گسترش شوری در اراضی قابل کشت تهدیدی جدی برای گیاهان زراعی حساس به تنش شوری از جمله برنج می باشد. با هدف دستیابی به ژن های نامزد دخیل در تحمل به تنش شوری در ژنوتیپ های متحمل برنج در این مطالعه از رویکرد تلفیقی شامل دو روش متا-QTL و متا-ترانسکریپتومیکس استفاده شد. آنالیز متا-QTL از ۲۶۶ QTL شناسایی شده مربوط به ۳۲ صفت، ۴۶ منطقه ی متا-QTL را شناسایی نمود که ۹۳۶۶ ژن را در بر می گرفتند. تعداد ۳۴۴۹ ژن شناسایی شده با روش متا-ترانسکریپتومیکس در مناطق متا-QTL قرار داشتند. آنالیز هستی شناسی ژن های با بیان افتراقی در مناطق متا-QTL نشان داد که انتقال دهنده های یونی و تنظیم کننده های رونویسی در بخش فرایند های بیولوژیکی و فعالیت انتقال دهندگی، فعالیت رونویسی و نیز فعالیت اکسیدوردوکتازی در بخش عملکردهای مولکولی به طور معنی داری غنی شدند. ۲۳ ژن کاندید در منطقه Saltol و مناطق hotspot برای دو صفت عملکرد و همواستازی یونی شناسایی شدند. برخی از این ژن های کاندید متعلق به دسته های تنظیم رونویسی، پراکسیداز، پکتین استراز، سازمان دهنده های دیواره سلولی، انتقال دهنده های پتاسیم و پروتئین های سرین/ترئونین می باشند. نتایج بدست آمده گویای این مطلب است که ژنوتیپ های متحمل به تنش شوری در دسته های درک و پیام رسانی تنش، تنظیم رونویسی و همچنین از بین برندگان ROS از مکانیسم های پاسخ گویی کارآمدتری استفاده می کنند.

کلیدواژه ها:

برنج ، تنش شوری ، متا-QTL ، متا-ترانسکریپتومیکس.