بررسی اهمیت پارامترهای مدل برای شبکه متابولیک تنظیمی در باکتری اشریشیا کلی

شبکه ی متابولیک یک مجموعه ی کامل از فرآیندهای متابولیک است که ویژگی های فیزیولوژی و بیوشیمیایی یک سلول را تعیین می کند. شبکه های متابولیک یک ابزار قدرتمند برای مطالعه و مدلسازی متابولیسم میباشند؛ با توجه به ماهیت دینامیک شبکه های متابولیک، اغلب از دستگاه معادلات دیفرانسیل برای مدلسازی استفاده میشود. این دستگاه معادلات بر اساس قانون بقای جرم برای هریک از متابولیتها تشکیل میشود. معادلات که رفتار سینتیکی آنزیمها را توصیف میکنند، به شدت غیرخطی هستند. همچنین تخمین پارامترهای سینتیکی از دشوارترین مراحل در مدلسازی دینامیکی میباشد؛ بنابراین در این مقاله با به کارگیری ساده ترین شکل سینتیک آنزیمی و ارائه مدل با استفاده از تحلیل حساسیت، میزان اهمیت پارامترهای مدل را مورد بررسی قرار میدهیم.

کلیدواژه ها:

شبک متابولیک ، مسیرهای متابولیک ، شبکه تنظیم ژنی ، زیست شناسی سامانه ها ، تحلیل حساسیت.