Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
ورود |عضویت رایگان |راهنمای سایت |عضویت کتابخانه ها
عنوان
مقاله

Bioinformatics analysis of functional SNP (A→G) at miR-499 in patients with breast cancer: Gallele is probable poor prognostic factor

دهمین کنگره بین المللی سرطان پستان
سال انتشار: 1393
کد COI مقاله: ICBCMED10_091
زبان مقاله: انگلیسیمشاهده این مقاله: 302
نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

مشخصات نویسندگان مقاله Bioinformatics analysis of functional SNP (A→G) at miR-499 in patients with breast cancer: Gallele is probable poor prognostic factor

Shahrzad Kabirizadeh - Department of Biology, Payame Noor University, Yazd, Iran
Hamzeh Mesrian Tanha - Department of Biology, Faculty of Science, University of Isfahan, Isfahan, Iran
Kamran Ghaedi - Department of Biology, Faculty of Science, University of Isfahan, Isfahan, Iran
Mansoureh Azadeh - Zistfanavari Novin biotechnology institute, Isfahan, Iran

چکیده مقاله:

Background: MicroRNAs (miRNAs) are endogenous small non-coding RNAs. In animals, miRNAs were found to hybridize to 3’ untranslated regions (3’UTRs) and mediate mRNA cleavage or translational inhibition. These kinds of RNAs are important class of regulators that were reported to beinvolved in a wide range of biological processes such as cell signaling and cancers. Genetic polymorphisms, especially single nucleotide polymorphisms (SNPs) can affect miRNA regulation via different molecular mechanisms and associated with various phenotypic differences. First,polymorphisms within precursor miRNAs (pre-miRNAs) were found to affect miRNA expression possibly via altering pre-miRNA processing. Second, polymorphisms in miRNA target sites had been extensively studied and implicated in a variety of human diseases. There are over 100 different types of cancer, and each is classified by the type of cell that is initially affected. Breast cancer is a type of cancer which malignant cells form in the tissues of the breast. According to the World Health Organization, breast cancer is the most common diagnosed cancer in women.Objective: the aim of our study is to expand current knowledge about molecular function of miR-499 and its SNP as a potential biomarker in breast tumor cells by using bioinformatics tools. Material and methods: dbSNP in NCBI, miRNASNP, UniGene, KEGG and DAVID databases wereused for bioinformatics analysis. Validated and predicted targets of miR-146a were obtained from miRtarbase and miRwalk databases. Patterns of targetome genes expression in breast tumor and normal mammary glands were investigated by Unigene database. DAVID database was used for miR-146a enrichment analysis.Results and conclusion: Our data manifested KEGG signaling pathways pathway in cancer as the most statistical relevant pathway with miR-146a targetome. miR-499 in breast tumor cells may target angiogenesis related mRNAs such as KITLG, FGF, PDGFR, SOS, STAT3, IKK and iNDS. Stabilityreduction of stem-loop structure of mir-499 due to G allele gains angiogenesis pathway. As a result allele G may associate with poor prognosis of breast cancer. To sum up, miR-499 is a potential tumor suppressor miRNA which could be used as a worthwhile prognostic biomarker. Allele G in the SNP could have prognostic value for breast cancer centers due to its effect on mir-146a stability. The exact role of mir-499 and the SNP needs further investigation.

کلیدواژه ها:

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

کد یکتای اختصاصی (COI) این مقاله در پایگاه سیویلیکا ICBCMED10_091 میباشد و برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/726531/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Kabirizadeh, Shahrzad and Mesrian Tanha, Hamzeh and Ghaedi, Kamran and Azadeh, Mansoureh,1393,Bioinformatics analysis of functional SNP (A→G) at miR-499 in patients with breast cancer: Gallele is probable poor prognostic factor,10th International Breast Cancer Congress,Tehran,https://civilica.com/doc/726531

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1393, Kabirizadeh, Shahrzad؛ Hamzeh Mesrian Tanha and Kamran Ghaedi and Mansoureh Azadeh)
برای بار دوم به بعد: (1393, Kabirizadeh؛ Mesrian Tanha and Ghaedi and Azadeh)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: پیام نور
تعداد مقالات: 61,361
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

پشتیبانی