آنالیز بیوانفورماتیکی ناحیه پروموتوری ژن GAIدر برخی گونه های چوبی گردو وانگور، دو لپه ای سویا و آرابیدوپسیس و تک لپه ای برنج

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 543

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

BSCONF05_099

تاریخ نمایه سازی: 22 دی 1396

چکیده مقاله:

بخش عمده ای از تنظیم بیان ژن های گیاهی مربوط به ناحیه پروموتوری می باشد. آنالیز ناحیه پروموتوری و افزایش اطلاعات در زمینه نحوه بیان و عوامل موثر در افزایش یا کاهش بیان ژن ها برای درک مکانیسم و نحوه کار آن بسیار مفید خواهد بود. در پژوهش حاضر ناحیه پروموتوری ژن GAI در برخی گونه های چوبی (گردو و انگور)، دو لپه ای (سویا و آرابیدوپسیس) و تک لپهای (برنج) به صورت in silico مورد بررسی قرار گرفت. آنالیز دادهها بیانگر وجود 6 عنصرتنظیمی پاسخ به هورمونهای متیل جاسمونات، جیبرلین، سالسیلیک اسید، آبسیزیک اسید، اکسین و اتیلن بود. اکثر موتیف های پاسخ دهنده به هورمون متیل جاسمونات CGTCA-motif) و (TGACG-motif تقریبا در همه گونه ها یکسان بود. موتیف TCA-element در انگور 4 برابرآربیدوپسیس بود در حالیکه بقیه گونه ها این موتیف را نداشتند. GARE-motif به عنوان اصلی ترین موتیف درگیر در سنتز جیبرلین فقط در گیاهان چوبی یافت شد.

نویسندگان

راحله قاسم زاده

استادیار گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه ارومیه

پریناز جعفرپور

کارشناسی ارشد گروه علوم باغبانی، دانشگاه ارومیه

مهدی محسنی آذر

کارشناس گروه علوم باغبانی، دانشگاه ارومیه