بررسی اپیدمیولوژی مولکولی جدای ههای گاوی گوسفندی و بزی مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس موجود در بانک میکروبی موسسه تحقیقات واکسن و سر مسازی رازی با استفاده از روش Short Sequence Repeats SSR sequencing

مایکوباکتریوم آویوم زیرگونه پاراتوبرکولوزیس )MAP )در نشخوارکنندگان عامل ایجاد پاراتوبرکولوزیس میباشد که بدلیل تحمیل خسارتهای اقتصادی گسترده از اهمیت اقتصادی زیاد برخوردار میباشد. در سالهای اخیر استفاده از توالیهای تکراری کوتاه در ژنوتایپینگ این باکتری مورد توجه قرار گرفته است. در مطالعه حاضر نتایج حاصل از کاربرد این روش با اتکا بر روی 2 لوکوس SSR8 و SSR9 بر روی 3 جدایه کلینیکی و 1 سویه مرجع مورد بررسی قرار گرفته است. سه جدایه ایرانی گاوی، گوسفندی و بزی همراه با یک سویه آزمایشگاهی به نام V & III MAP در بررسی وارد شدند. از آزمایشهای F57-PCR و IS900-PCR برای تعیین هویت همه باکتریهای تحت بررسی استفاده شد. بر اساس روش پیشنهادی Amonsin همه باکتری ها با تمرکز بر دو لوکوس SSR8 و SSR9 ژنوتایپینگ SSR گردیدند. در هر یک از دو لوکوس SSR8 و SSR9 در میان باکتریهای تحت بررسی دو الل شناسایی گردید بطوریکه که در SSR8 آلل بزرگتر بطول bp781 و الل کوچکتر با bp778 و در SSR9 دو الل bp581و bp578 شناسایی گردیدند. دو جدایه گاوی و گوسفندی MAP همراه با سویه آزمایشگاهی دارای یک الگوی مشابه بودند در حالیکه سومین جدایه )بزی( یک تیپ منفرد متفاوت از خود نشان داد. مشاهده دو سویه در بین سه جدایه ایرانی تحت بررسی احتماال میتواند نشانه وجود سطح قابل توجهی از تنوع ژنتیکی این باکتری در ایران باشد اما اثبات این فرضیه نیازمند انجام مطالعات تکمیلی خواهد بود.

کلیدواژه ها:

مایکوباکتریوم آویوم زیر گونه پاراتوبرکولوزیس8 ، SSR9 F57 ، SSR ، IS900