بررسی و شناسایی miRNA های ریشه گیاه برنج در شرایط نرمال و تنش خشکی

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 732

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI08_0812

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

چکیده مقاله:

هاmiRNA، هایRNA کوچک 21-نوکلئوتیدی هستند که نقش مهمی را در تنش های غیرزنده دارند . تا کنون تحقیق گسترده های به خصوص در ریشه برای شناسایی miRNA هایی که در تنش خشکی تغییر بیان نشان می دهند ، انجام نشده است . در این تحقیق ، با استفاده از توالبایی با کارایی بالا، miRNA های مرتبط با تنش خشکی شناسایی شده است . در این مطالعه ، تعداد 28469954 و 25048989 توالی به عنوان RNA کوچک به ترتیب برای کتابخانه های نرمال و خشکی شناسایی شد . بررسی پراکنش طولی RNA های کوچک نشان داد که ، 21نوکلئوتیدیها فراوانترین RNA های کوچک از نظر طولی هستند . نتایج نشان داد که ، ترجیح نوکلئوتیدی در جایگاه اولین نوکلئوتید برای Mirna های 21 نوکلئوتیدی اوراسیل و برای miRNaهای 24 نوکلئوتیدی اوراسیل و آدنین است . در این تحقیق تعداد 9298 عدد miRNA در مجمعوع هر دو کتابخانه شناسایی شد . فراوانترین miRNAها در کتابخانه ها به ترتیب miR168aj ، miR156a-J و MiR166a-d،F،n بودند . نتایج نشان داد که هجده miRNA در اثر تنش خشکی افزایش بیان و سی و چهار miRNA کاهش بیان داشته اند . همچنین در miRNA های جدید شناسایی شده یازده و نه miRNA به ترتیب ،کاهش و افزایش بیان نشان داد ند . بررسی ژنهای هدف miRNAها، تعداد 496ژن هدف از جمله Auxin response factorها را مشخص کرد . همچنین بررسی انتولوژی ژنها نشان داد که اکثر این ژنها در پروسه

کلیدواژه ها:

برنج ، miRNA ، small RNA و تنش خشکی

نویسندگان

بهنام بخشی

دانشجوی دکتری دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران

محمدرضا بی همتا

هیات علمی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

احسان محسنی فرد

دانشجوی دکتری دانشگاه فردوسی مشهد

قاسم حسینی سالکده

هیات علمی پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران هیات علمی پژوهشگاه رویان