بررسی و شناسایی miRNA های ریشه گیاه برنج در شرایط نرمال و تنش خشکی
سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 732
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0812
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
هاmiRNA، هایRNA کوچک 21-نوکلئوتیدی هستند که نقش مهمی را در تنش های غیرزنده دارند . تا کنون تحقیق گسترده های به خصوص در ریشه برای شناسایی miRNA هایی که در تنش خشکی تغییر بیان نشان می دهند ، انجام نشده است . در این تحقیق ، با استفاده از توالبایی با کارایی بالا، miRNA های مرتبط با تنش خشکی شناسایی شده است . در این مطالعه ، تعداد 28469954 و 25048989 توالی به عنوان RNA کوچک به ترتیب برای کتابخانه های نرمال و خشکی شناسایی شد . بررسی پراکنش طولی RNA های کوچک نشان داد که ، 21نوکلئوتیدیها فراوانترین RNA های کوچک از نظر طولی هستند . نتایج نشان داد که ، ترجیح نوکلئوتیدی در جایگاه اولین نوکلئوتید برای Mirna های 21 نوکلئوتیدی اوراسیل و برای miRNaهای 24 نوکلئوتیدی اوراسیل و آدنین است . در این تحقیق تعداد 9298 عدد miRNA در مجمعوع هر دو کتابخانه شناسایی شد . فراوانترین miRNAها در کتابخانه ها به ترتیب miR168aj ، miR156a-J و MiR166a-d،F،n بودند . نتایج نشان داد که هجده miRNA در اثر تنش خشکی افزایش بیان و سی و چهار miRNA کاهش بیان داشته اند . همچنین در miRNA های جدید شناسایی شده یازده و نه miRNA به ترتیب ،کاهش و افزایش بیان نشان داد ند . بررسی ژنهای هدف miRNAها، تعداد 496ژن هدف از جمله Auxin response factorها را مشخص کرد . همچنین بررسی انتولوژی ژنها نشان داد که اکثر این ژنها در پروسه
نویسندگان
بهنام بخشی
دانشجوی دکتری دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران
محمدرضا بی همتا
هیات علمی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
احسان محسنی فرد
دانشجوی دکتری دانشگاه فردوسی مشهد
قاسم حسینی سالکده
هیات علمی پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران هیات علمی پژوهشگاه رویان