بررسی اعضای خانواده ژنی NAD(P)H دهیدروژناز در گیاهان دارویی ریحان و خردل سفید در تنش خشکی

یکی از خانواده های ژنی پاسخ دهنده به تنش خشکی در گیاهان دارویی همچون ریحان و خردل سفید خانواده ژنی NADPH دهیدروژناز (NDH) است. این خانواده ژنی اعضای مختلفی دارد که بررسی آنها از نظر فیلوژنتیکی، برهمکنش پروتئینی و هم بیانی می توانند درک عمیقی از نقش این خانواده ژنی در پاسخ به تنش خشکی در گیاهان دارویی داشته باشد. در این مطالعه اعضای خانواده ژنی NADPH دهیدروژناز در گیاهان دارویی ریحان و خردل سفید بر اساس گیاه مدل آرابیدوپسیس از نظر فیلوژنتیکی و برهمکنش پروتئینی بررسی و کلاستربندی شدند. سپس آنالیز هم بیانی ژنها و عملکرد آنها بر اساس گیاه مدل آرابیدوپسیس مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که هر کدام از اعضای خانواده ژنی NDH در گیاهان دارویی ریحان و خردل سفید و گیاه مدل آرابیدوپسیس بسیار مشابه بوده و حفاظت شده هستند. نتایج کلاستربندی اعضای این خانواده ژنی نشان داد که ژنهای ndhaEndhaBndhaa و ndhaG در یک کلاستر و ژنهای ndhaH و ndhaF در یک کلاستر و ژنهای ndhak ndhaJ، ndhaH، ndhaD، ndhaC در یک کلاستر برهمکنش پروتئینی قرار گرفتند. نتایج نشان داد که اعضای خانواده ژنی NDH با ژنهای مهمی مانند NADIB NADIA، NAD۴L NAD۳ NAD۲A NADIC و NAD۵A هم بیان هستند و در فعالیت اکسیدوردوکتازی مرتبط با NADPH، کمپلکس اکسیدوردوکتاز و کمپلکس NADHدهیدروژناز نقش دارند اعضای خانواده ژنی NDH در شرایط تنش خشکی در گیاهان دارویی همچون ریحان و خردل سفید بسیار مهم بوده و میتوانند در برنامه های بهنژادی گیاهان دارویی مورد توجه قرار گیرند.

کلیدواژه ها:

آرابیدوپسیس ، برهمکنش پروتئینی ، بیوانفورماتیک ، فیلوژنتیکی ، هم بیانی