ارزیابی ژنومی روش ماشین بردار پشتیبان در بروز متفاوت فنوتیپ آستانه ای

یک جمعیت پایه ۱۰۰۰ راسی برای ۱۰۰۰ نسل با استفاده از نرم افزار QMSim شبیه سازی شد. جمعیت های ژنومی برای سطوح مختلف وراثت پذیری ۰/۰۵ و ۰/۲، عدم تعادل پیوستگی ۰/۲۲۱ و ۰/۴۳۵ و تعداد متفاوت جایگاه صفات کمی ( ۱۰۰ و ۱۰۰۰ ) بر روی ۲۹ کروموزوم شبیه سازی شدند. جهت آنالیز داده هایشبیه سازی شده سه مدل آماری شامل: ماشین بردار پشتیبان، بهترین پیش بینی ناریب خطی ژنومی و بیز لاسوبه کار گرفته شد.به طور کلی وراثت پذیری صفت عاملی موثر بر سطح زیر منحنی مشخصه عملکرد ژنومی روش هایآماری ماشین بردار پشتیبان، بیز لاسو و بهترین پیش بینی ناریب خطی ژنومی بود. نتایج این تحقیق نشان دادکه سطح بالای عدم تعادل پیوستگی میان جایگاه های صفت کمی و نشانگرها، باعث افزایش احتمالنمونه گیری نشانگرهای مجاور در روش های باز نمونه گیری می شود، که این امر عملکرد مثبت ماشین بردارپشتیبان را به همراه داشت.با وجود سطح زیر منحنی مشخصه عملکرد ژنومی بالاتر بیز لاسو و بهترینپیش بینی ناریب خطی ژنومی در جمعیت های مختلف، هنگامی که صفات گسسته توسط تعداد زیادی جایگاهصفت کمی کنترل شدند، روش ماشین بردار پشتیبان عملکرد بهتری داشت

کلیدواژه ها:

بیز لاسو ، صحت ژنومی ، یادگیری ماشین