بررسی بیان ژنهای MBOAT۷ و GALE به عنوان آنزیمهای کلیدی در نمونههای سرطان پستان بر اساس مطالعات ex vivoو ارتباط بیان آنها با بدخیمی بر اساس مطالعات بیوانفورماتیکی

هدف از این مطالعه بررسی تغییرات بیان MBOAT۷ و GALE در سرطان پستان و ارتباط بیان آنها با نرخ مرگ و میر بیماران و مسیرهای مرتبط با بدخیمی بود.به منظور بررسی تغییرات بیان MBOAT۷ و GALE در سرطان پستان از پایگاه TCGA استفاده شد. همچنین برای شناسایی مسیرهای مرتبط با شبکه هم بیانی، ژن های موجود در شبکه توسط پایگاه enrichr غنی سازی شدند و از مخزن MSigDB برای این هدف استفاده شد. از دادههای کلینکی TCGA برای بررسی ارتباط بیان MBOAT۷ و GALE با نرخ مرگ و میر بیماران استفاده شد. به منظور تایید نتایج، تعداد ۲۵ عدد بافت توموری و ۲۵ عدد بافت نرمال تهیه شده و در ادامه پس از استخراج RNAو سنتز cDNA سطح بیان ژن کاندید مورد ارزیابی قرار گرفت. آنالیز نتایج حاصل از ریل تایم با نرم افزار GraphPad Prismانجام شد.نتایج برای ژن GALE نشان داد که سطح بیان این ژن به طور معنی دار و با معیار R>۰.۵ با ۱۲۷ ژن دیگر هم بیانی داشت. نتایج غنی سازی برای این ۱۲۷ ژن نشان داد که تعدادی از آنها در مسیرهای مانند Glycolysis، Oxidative Phosphorylation، Protein Secretion و Reactive Oxygen Species Pathway نقش دارند. از طرفی دیگر بررسیهای ما نشان داد که MBOAT۷ با ۹۹ ژن دیگر به طور معنی دار و با معیار R>۰.۵ همبستگی بیان در دادههای TCGA داشت. نتایج مسیر یابی برای ۹۹ ژن مرتبط با MBOAT۷ در شبکه هم بیانی نشان داد که بعضی از انها به طور معنی داری در مسیرهایی مانند Estrogen Response و Oxidative Phosphorylation درگیر هستند.بر اساس یافته های این پژوهش می توان نتیجه گرفت، سطح بیان ژن های GALE و MBOAT۷ با سرطان پستان در ارتباط هستند. این نتایج پیشنهاد میدهد که MBOAT۷ و GALE میتوانند از طریق مسیرهای ذکر شده در بدخیمی سرطان پستان نقش داشته باشند.

کلیدواژه ها:

سرطان پستان ، ژن GALE ، ژن MBOAT۷ ، مطالعات بیوانفورماتیکی