ارزیابی تنوع ژنتیکی گندم های اینکورن غرب ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 623

فایل این مقاله در 26 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-12-2_009

تاریخ نمایه سازی: 26 شهریور 1399

چکیده مقاله:

هدف: وجود تنوع ژنتیکی در گیاهان زراعی و اجداد وحشی آن ها نقش مهمی در پیشرفت برنامه های به نژادی دارد. گونه اینکورن (Triticum monococcum L. ssp. boeoticum) در نواحی غربی ایران تنوع وسیع و پراکنش جغرافیایی گسترده ای دارد. هدف از این تحقیق بررسی تنوع ژنتیکی گندم های اینکورن جمع آوری شده از این منطقه با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای بود. مواد و روش ها:تنوع ژنتیکی 163 ژنوتیپ گندم اینکورن جمع آوری شده از 34 مکان متفاوت از سه استان غربی ایران با استفاده از 19 جایگاه ژنی SSR از ژنوم A گندم هگزاپلویید بررسی شد. نتایج: در 163 ژنوتیپ گندم اینکورن مورد مطالعه در مجموع 151 آلل چندشکل برای 19 جایگاه ریزماهواره ای با میانگین 94/7 شناسایی شد. دامنه محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC)  در ژنوتیپ های مورد مطالعه بین 64/0 برای جایگاه ژنی Xgwm480-3A تا 89/0 برای جایگاه ژنی Xgwm4-4A متغیر بود. میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی در ژنوتیپ های مورد مطالعه 77/0 بود. با توجه به نتایج بدست آمده جایگاه های ژنیXgwm4-4A ، Xgwm610-4A و Xgwm282-7A مناسب ترین جایگاه ها برای بررسی تنوع ژنتیکی و تمایز ژنوتیپ های مورد مطالعه گندم اینکورن تشخیص داده شدند. میانگین ضریب شانون به میزان 16/0 نشان دهنده تنوع متوسط در ژنوتیپ های تحت بررسی بود. متوسط مکان های ژنی چندشکلی در 34 جمعیت مورد مطالعه 74/36 درصد و میانگین هتروزیگوسیتی برابر 114/0 برآورد شد. بر اساس نتایج تجزیه واریانس مولکولی برای 34 جمعیت گندم اینکورن، اختلاف بین و درون جمعیت های مورد مطالعه به ترتیب 7 و 93 درصد مشاهده شد. تجزیه خوشه ای با استفاده از ضرایب جاکارد و بر اساس الگوریتم UPGMA ژنوتیپ های­ مورد مطالعه گندم اینکورن را در 10 گروه طبقه بندی نمود. طبق نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی دو بردار اولیه به ترتیب 33/29 و 01/24 درصد از کل واریانس ژنتیکی مولکولی را تبیین نمودند.  نتیجه گیری: نتایج حکایت از مفید بودن نشانگرهای ریزماهواره در شناسایی و گروه بندی ژنوتیپ های گندم اینکورن داشت، به طوریکه از اطلاعات بدست آمده می توان در پروژه های اصلاحی، برنامه ریزی حفاظت ژرم پلاسم و ایجاد کلکسیون از جمعیت های گندم اینکورن استفاده نمود.

کلیدواژه ها:

غرب ایران ، گندم اینکورن ، نشانگرهای SSR ، Triticum monococcum L. ssp. boeoticum

نویسندگان

محمد مهدی پورسیاه بیدی

گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران

کیانوش چقامیرزا

گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران

صحبت بهرامی نژاد

گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران

احمد ارزانی

اصفهان اصفهان - دانشگاه صنعتی اصفهان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • ارتباط بین صفات کیفی دانه و نشانگرهای مولکولی SSR در برخی از ژنوتیپ های گندم نان [مقاله ژورنالی]
  • خارستانی هادی، نصراله نژادقمی علی اصغر، مهرابی علی اشرف (1292) ... [مقاله ژورنالی]
  • بررسی مولکولی تنوع ژنتیکی در لاین های دابل هاپلوئید گندم نان با استفاده از نشانگرهای SSR [مقاله ژورنالی]
  • عبدالهی سیسی نیر؛ محمدی سیدابوالقاسم؛ علوی کیا سید سیامک؛ صادق ...
  • بررسی تنوع ژنتیکی ارقام گندم نان (Triticum aestivum L.) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره [مقاله ژورنالی]
  • کافی هانیه، نوابپور سعید، زینلی­نژاد خلیل، پهلوانی محمدهادی (1397) ارزیابی ...
  • کوهستانی محمد؛ صادق زاده بهزاد؛ ابراهیمی محمدعلی؛ یوسفی ولی اله ...
  • محمدی مجید؛ میرفخرایی رضاقلی؛ عباسی علیرضا (1392) مطالعه تنوع ژنتیکی ...
  • نظری مریم؛ و عبدالشاهی روح اله (1393) بررسی تنوع ژنتیکی ...
  • واجد ابراهیمی محمدتقی؛ محمدآبادی محمدرضا؛ اسماعیلی زاده علی (1396) بررسی ...
  • واجدابراهیمی محمدتقی، محمدآبادی محمدرضا، اسمعیلی زاده کشکوئیه علی (1394) بررسی ...
  • Abdollahi-Sisi N, Mohammadi SA, Alavikia S, Sadeghzadeh B (2012) Analysis ...
  • Anderson JA, Churchill GA, Autrique JE et al. (1993) Optimizing ...
  • Arzani A, Ashraf M (2017) Cultivated ancient wheats (Triticum spp.): ...
  • Chambers GK, Macavoy ES (2000) Microsatellites: consensus and controversy. Comp ...
  • Doyle JJ, Doyle, JL (1990) Isolation of plant DNA from ...
  • FAO. 2017. FAOSTAT Database. Available online at: http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC ...
  • Gupta PK, Varshney RK (2005) Cereal genomics: an overview. Springer ...
  • Ghasemi N, Mirfarkhai RH, Abbasi AS (2019) Genetic diversity of ...
  • Hammer K, Filatenko AA, Korzun V (2000) Microsatellite markers - ...
  • Harlan JR, Zohary D (1996) Cultivated einkorn=Triticum monococcum L.subsp. monococcum ...
  • Ismaili A, Nazarian Firoozabadi F, Samiey K. and Drikvand R ...
  • Jannik JL, Bink MC, Jansen RC (2001) Using complex plant ...
  • Kafi H, Navabpour S, Zaynali Nezhad KH, Pahlavani MH (2018) ...
  • Kalivas A, Xanthopoulos F, Kehagia O, Tsaftaris AS (2011) Agronomic ...
  • Kharestani H, Nasrolah Nejad Qomi AA, Mehrabi AA (2013) Genetic ...
  • Kouhestani M, Sadeghzadeh S, Ebrahimi MA, Yousefi A (2016) Identification ...
  • Kumar R, Kumar A, Kumar SA, Radha J (2012) Evaluation ...
  • Liu J, Liu L, Hou N, Zhang A (2007) Genetic ...
  • Mardia KV, Kent JT and Bibby JM (1979) Multivariate analysis. ...
  • Maxted NBV, Ford-Lloyd SL, Jury SP, Kell MA Scholten. (2006) ...
  • Mir Drikvand R, Khyrolahi A, Ebrahimi A, Rezvani M (2015) ...
  • Mizumoto K, Hirosawa S,Nakamura C, Takumi S (2002) Nuclear and ...
  • Mohammadi SA, Prasanna BM (2003) Analysis of genetic diversity in ...
  • Mohammadi M, Mirfakhraii RG, Abbasi A (2013) Genetic diversity in ...
  • Naghavi MR, Malaki M, Alizadeh H et al. (2009) An ...
  • Nazari M, Abdolshahi R (2014) Evaluation of genetic diversity in ...
  • Nei, M, Li WH (1979) Mathematical model for studying genetic ...
  • Pahlavani S, Izanloo A, Parsa S, Ghaderi MG (2016) Association ...
  • Pirseyedi SM, Mardi M, Naghavi MR et al. (2006) Evaluation ...
  • Rafalski JA, Vogel JM, Morgante M et al. (1996) Generating ...
  • Roussel V, Leisova L, Exbrayat F et al. (2005) SSR ...
  • Salehi M, Arzani A, Talebi M, Rokhzadi A (2018) Genetic ...
  • Salvi S, Tuberosa R (2005) To clone or not to ...
  • Vajed Ebrahimi MT, Mohammad Abadi MR, Esmailizadeh AK (2016) Analysis ...
  • Vajed Ebrahimi MT, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh AK (2017) Genetic Diversity ...
  • Wang H, Wang X, Chen P, Liu D (2007) Assessment ...
  • Warschefsky E, Penmetsa RV, Cook DR, von Wettberg EJB (2014) ...
  • Williams JGK, Kubelik AR, Livak KJ et al. (1990) DNA ...
  • Zargani M, Ranjbar GA, Ebrahim Nejad Sh (2015) Molecular assessment ...
  • Zhang HY, Liu XZ, Li TS, Yang YM­ (2006) ­ ...
  • نمایش کامل مراجع