بررسی مولکولی تنوع ژنتیکی در لاین های دابل هاپلوئید گندم نان با استفاده از نشانگرهای SSR

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 166

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCB-7-15_010

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400

چکیده مقاله:

گندم با نام علمی (Triticum aestivum L.) گیاهی یک ساله و خودگشن، از خانواده گندمیان و دارای سه گروه ۱۴، ۲۸ و ۴۲ کروموزومی با فرمول ژنومی AA، AABB، AABBDD می باشد که کروموزوم ها در سه ژنوم همیولوگ A، B و D قرارگرفته اند. ژنوم گندم بسیاربزرگ، شامل ۱۰۹× ۱۶ جفت باز بوده و دارای حدود ۸۰ درصد DNA تکراری با متوسط ۸۱۰ مگا جفت باز در هر کروموزوم با طول ۱۰ میکرومتر است. گندم به عنوان مهم ترین گیاه زراعی در جهان و ایران و از جمله محصولات اساسی و استراتژیک است. این گیاه که نقش و اهمیت زیادی از جنبه های مختلف، هم در تولید و هم مصرف دارد و دارای ژنوتیپ های زیادی است که لازمه استفاده کارآمد و صحیح از آنها، شناسایی روابط ژنتیکی ژنوتیپ ها و تعیین سطوح تنوع می باشد. هدف از این مطالعه بررسی تنوع ژنتیکی و تعیین فاصله ژنتیکی بین تعداد ۹۱ لاین دابل هاپلوئید موجود به همراه دو والد آنها با استفاده از نشانگرهای SSR (میکروساتلایت یا ریزماهواره) و ارزیابی توانایی ریزماهواره در تشخیص محتوای چندشکلی بر اساس تفاوت های موجود در ژرم پلاسم آنها می باشد. بر این اساس، تعداد آلل های چندشکل از ۲ تا ۸ با میانگین ۶/۵ متغیر بود و آغازگر Xgwm۱۸۶ با ۶ آلل بیشترین مقدار چندشکلی (۸۷/۰) و آغازگر Xgwm۴۶ با ۲ آلل کمترین مقدار چندشکلی (۱۲/۰) را نشان دادند. بعلاوه تعداد کل باندهای محاسبه شده توسط ۱۱ جفت آغازگر SSR برابر ۳۹ باند بود. تنوع و روابط ژنتیکی نمونه ها توسط روش های آماری نی و لی و UPGMA بررسی شد و هرکدام از لاین های مورد بررسی در گروههای مشترک طبقه بندی شدند.

نویسندگان

مهدی زرگانی

دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

غلامعلی رنجبر

دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

شاهپور ابراهیم نژاد

مرکز تحقیقات کشاورزی مازندران (قراخیل)

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Agrama, H. and M.R. Tuinstra. ۲۰۰۳. Phylogenetic diversity and relationship ...
  • Akkaya, M.S., A.A. Bhagwat and P.B. Cregan. ۱۹۹۲. Length polymorphism ...
  • Barakat, M.N., A.A. Al-Doss, A.A Elshafei, K.A. Moustafa and E.I ...
  • Bryan, G.J., A.J. Collins, P. Stephanson, A. Orry, J.B. Smith ...
  • Christiansen, M.J., S.B. Anderson and R. Ornz. ۲۰۰۲. Diversity changes ...
  • Dellaporta, S.L., J. Wood and J.B. Hicks. ۱۹۸۳. A plant ...
  • Donini, P., P. Stephenson, G.J. Bryan and R.M.D Kobner. ۱۹۹۸. ...
  • Eujayl, I., M.E. Sorrells, M. Baum, P. Wolters and W. ...
  • Fahima, T., M. Roder, A. Grama and E. Nevo. ۱۹۹۸. ...
  • Gupta, P.K., R.K. Varshney, P.C. Sharma and R. Ramesh. ۱۹۹۹. ...
  • Gupta, P.K., H.S. Balyan, K.J. Edwards, P. Isaac, V. Korzun, ...
  • Zhou, H.F., Z.W. Xie and S. Ge. ۲۰۰۳. Microsatellite analysis ...
  • Halton, T.A. ۲۰۰۱. Plant genotyping by analysis of microsatellite. In ...
  • Hokanson, S.C., A.K. Szewc-McFadden, W.F. Lamboy and J.R. McFerson. ۱۹۹۸. ...
  • Ma, Z.Q., M. Roder and M.E. Sorrelis. ۱۹۹۶. Frequencies and ...
  • Maccaferri, M., M.C. Sanguineti, P. Donini and R. Tuberosa. ۲۰۰۳. ...
  • Nei, N. and W. Li. ۱۹۷۹. Mathematical model for studying ...
  • Pestsov, E., V. korzun, N.P. Goncharov, K. Hammer, M.W. Ganal ...
  • Plaschke, J., M.W. Ganal and M.S. Roder. ۱۹۹۵. Detection of ...
  • Powell, W., M. Morgante, C. Andre, M. Hanafey, J. Vogel, ...
  • Prasad, M, R.K. Varsheny, J.K. Roy, H.S. Balyan and P.K. ...
  • Ranjbar, G.A., G.J. Hollamby, K.W. Shepherd and A.K.R.F. Islam. ۱۹۹۶. ...
  • Röder, M.S., J. Plaschke, S.U. Konig, A. Borner, M.E. Sorrells, ...
  • Röder, M.S., V. Korzun, K. Wendehake, J. Plaschke, M.H. Tixier, ...
  • Rohlf, F.J. ۲۰۰۰. NTSYS-pc: numerical taxonomy and multivariate analysis system, ...
  • Saghai Maroof, M.A., R.M. Blyashev, G.P. Yang, Q. Zhang and ...
  • Saghai-Maroof, M.A., K.M. Soliman, R.A. Jorgensen, and R.W. Allard. ۱۹۸۴. ...
  • Senior, M.L. and M. Heun. ۱۹۹۳. Mapping maize microsatellites and ...
  • Stachel, M., T. Lelley, H. Grausgruber and J. Vollmann. ۲۰۰۰. ...
  • Tautz, D. and M. Renz. ۱۹۸۴. Simple sequence is ubiquitous ...
  • Wu, K.S. and S.D. Tanksley. ۱۹۹۳. Abundance, polymorphism and genetic ...
  • www. promega.com, Silver Sequence™ DNA Sequencing System Instructions for USA ...
  • Zar, M., J. Ahmadi, G.A. Gerosi and A.H. Beyki. ۲۰۱۱. ...
  • نمایش کامل مراجع