مکان یابی ژن های کمی کنترل کننده محتوای کلروفیل در شرایط نرمال و تنش شوری در گیاهچه های برنج و مقایسه روش های مختلف مکان یابی QTL

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 482

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ESCS-13-2_021

تاریخ نمایه سازی: 9 تیر 1399

چکیده مقاله:

شوری یک محدودیت عمده در توسعه کشت برنج می باشد. بهبود بخشیدن به تحمل به شوری در برنج ازنظر ژنتیکی یک مسئله بسیار مهم در برنامه های اصلاحی است. به منظور مکان یابی ژن های کنترل کننده محتوای کلروفیل، 96 لاین خالص نوترکیب برنج ایرانی حاصل تلاقی ارقام ندا × اهلمی-طارم تحت تنش شوری در مرحله گیاهچه ای آزمایشی به صورت مرکب در قالب طرح کاملا تصادفی با سه تکرار و دو شرایط کشت نرمال و تنش شوری در دانشگاه گنبد کاووس در سال 1395 در شرایط گیاهچه کشت شدند. مکان یابی ژن های کنترل کننده محتوای کلروفیل با استفاده از روش های مختلف مکان یابی شامل SIM-MEL، SIM، CIM، MIM، PMLE، ICIM و STSIM انجام گرفت و با استفاده از هر کدام از این روش ها QTL های مشابه و متفاوتی ردیابی شد. 40 نشانگر SSR و 16 نشانگر ISSR (76 آلل تکثیر شده چند شکل)، 2 نشانگر IRAP (7 آلل تکثیر شده چند شکل) و یک نشانگر iPBS (3 آلل تکثیر شده چند شکل) بر روی 12 کروموزوم برنج توزیع شدند. روش ICIM، CIM و SIM در شرایط نرمال و تنش شوری بیشترین تشابه مکان های ژنی ردیابی شده را دارا بودند. qCHL-6 در شش روش مکان یابی در موقعیت 52 سانتی مورگان از کروموزوم 6 شناسایی شد. بنابراین با استفاده از QTL های شناسایی شده می توان پس از تعیین اعتبار QTLها، ژنوتیپ های برتر از نظر محتوای کلروفیل برای برنامه های انتخاب به کمک نشانگر را شناسایی کرد.

نویسندگان

سمیه سنچولی

دانشجوی کارشناسی ارشد رشته بیوتکنولوژی کشاورزی، مجتمع آموزش عالی شیروان

محمود قربانزاده نقاب

دانشیار گروه تولیدات گیاهی، مجتمع آموزش عالی شیروان

حسین صبوری

دانشیار تولیدات گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبد کاووس

محمد زارع مهرجردی

دانشیار گروه تولیدات گیاهی، مجتمع آموزش عالی شیروان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Alam, M.Z., Stuchbury, T., Naylor, R.E.L., Rashid, M.A., 2004. Effect ...
  • An, Z.W., Xie, L.L., Cheng, H., Zhou, Y., Zhang, Q., ...
  • Arvin, P., 2015. Effect of gibberellin on some vegetative traits, ...
  • Ebadi, A.A., Allahgholipour, M., Sharafi, N., 2018. Analysis of quantitative ...
  • Fukuda, A., Terao, T., 2015. QTLs for shoot and chlorophyll ...
  • Gregorio, G.B., 1997. Tagging salinity tolerance genes in rice using ...
  • Haley, C.S., Knott, S.A., 1992. A simple regression method for ...
  • Haq, T. U., Akhtar, J., Gorham, J., Khalid, M., 2008. ...
  • Hu, S.P., Zhou, Y., Zhang, L., Zhu, X.D., Li, L., ...
  • Jiang, S., Zhang, X., Zhang, F., Xu, Z., Chen, W., ...
  • Kao, C.H., Zeng, Z. B., 1999. Multiple interval mapping for ...
  • Kosambi, D. D., 1944. The estimation of map distances from ...
  • Lander, E. S., Botestein, R., 1989. Mapping Mendelian factors underlying ...
  • Li, H. G., Wang, J., 2007. A modified algorithm for ...
  • Majidimehr, A., Amiri-Fahliani, R., 2016. Analysis of salinity effect on ...
  • Manly, K.F., Olson, J.M., 1999. Overview of QTL mapping software ...
  • Mc Couch, S. R., Cho, Y. G., Yano, M., Paul, ...
  • Mohammdi, S. A., 2008. New method of genetic structure analysis ...
  • Moradi, F., Abdelbagi, M. I., 2007. Response of photosynthesis, cholorophyll ...
  • Munns, R., Tester, M., 2008. Mechanisms of Salinity Tolerance. Plant ...
  • Nelson, J.C., 1997. QGENE: software for marker-based genomic analysis and ...
  • Pazira, A., 1985. Short opinion on soil salinity and alkaloid ...
  • Ping, F., Xiaomin, Y., Riqing, Z., Ping, W., 2004. QTLs ...
  • Rabiei, B., Mardani, KH, Sabouri, H., Sabouri, A., 2014. The ...
  • Rajabi, A., Borchard, D., 2015. QTL mapping for root yield ...
  • Rodriguez, I. R., and Miller, J. L., 2000. Using a ...
  • Sabouri, H., Rezai, A.M., Moumeni. A., 2008. Evaluation of salt ...
  • Sabouri. H., Rezai. A., Moumeni. A., Kavousi. M., Shokri, H., ...
  • Sabouri, H., Rezai, A., Moumeni, A., Kavousi, M., 2007a. Investigation ...
  • Sabouri, H., Rezai, A., Moumeni, A., Kavousi, M., 2007b. Investigation ...
  • Sabouri, H., Rezai, A., Moumeni, A., Kavousi, M., 2007c. Study ...
  • Sabouri, H., Biabani, A., Nakhzari, A., Mollashahi, M., Sabouri, A., ...
  • Sabouri, H., Sabouri, A., 2008. New evidence of QTLs attributed ...
  • Sabouri, H., Sabouri, A., Dadras, A. R., 2016. Advanced Quantitative ...
  • Sabouri, H., Sabouri, A., Nahvi, M., Dadres, A. R., Katozi, ...
  • Sabouri, H., 2008. Evaluation of genetic variety of iranain rice ...
  • Saghi Maroof, M.A., Biyaoshev, R.M., Yang, G.P., Zhang, Q., Allard, ...
  • Sato, T., Ueda, T., Fukuta, Y., Kumagai, T., Yano, M., ...
  • Shen, B., Zhuang, J., Zhang, K., Dai, W., Lu, Q., ...
  • Takai, T., Kondo, M., Yano, M., Yamamoto, T., 2010. A ...
  • Takehisa, H., Shimodate, T., Fukuta, Y., Ueda, T., Yano, M., ...
  • This, D., Borries, C., Souyris, I., Teulat, B., 2000. QTL ...
  • Wang, B., Lan, T., Wu, W.R., Li, W.M., 2003. Mapping ...
  • Wang, F., Wang, G., Li, X., Huang, J., Zheng, J., ...
  • Weidong, C., Jizeng, J., Jiyun, J., 2004. Identification and interaction ...
  • Xu, S., 2003. Estimating polygenic effect using markers of the ...
  • Zeng, Z. B., 1994. Precision mapping of quantitative trait loci. ...
  • Zhangh, D., Xing, M., God, H., 2003. Nuclear DNA analyses ...
  • نمایش کامل مراجع