ررسی بیوانفورماتیکی آنزیم α-mannosidase در هلو (Prunus persica)

میزان نرم شدگی میوه ها در عمر پس از برداشت آنها نقش مهمی دارد. یکی از فاکتورهای موثر بر نرمشدگی میوه ها آنزیم α-mannosidase است. در این تحقیق به بررسی حضور این آنزیم با توجه به مشخصات بیوانفوماتیکی در پایگاه های داده های ژنتیکی در گیاهان مختلف پرداخته شده است، تا به توان عملکرد این آنزیم در یک گیاه را به سایر گیاهانی که میزان مشابهت ساختاری و عملکردی این آنزیم در آنها بالا می باشد تعمیم داد. در بررسی Blast انجام شده مشخص گردید آنزیم α-mannosidase در 15 گیاه بررسی شده دارای هومولوژی بوده و درصد مشابهت آن از 98 درصد در گیاه Prunus avium تا 79 درصد در گیاه Herrania umbratica متغییر است. در بررسی میزان خویشاوندی آنزیم با استفاده از مقایسه دو به دو توالی ها در Alignment و هم چنین بررسی دندوگرام رسم شده مشخص گردید که این آنزیم در گیاهان بررسی شده به دو شاخه اصلی و نهایتا به پنج زیرشاخه تقسیم میگردند.

کلیدواژه ها:

آنزیم ، بیوانفورماتیک ، هلو ، ژن .α-mannosidase