استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی برای کشف بیومارکرها

بیومارکرها به عنوان تغییرات مولکولی یا بیوشیمیایی سلولی تعریف شده اند که قابل اندازه گیری در محیط هایی مانند بافت ها، سلول ها و مایعات بدن هستند. از دیدگاه بالینی، بیومارکر از قابلیت های بسیاری برخوردار است که به تشخیص مراحل مختلف بیماری ها و یا پاسخ به یک درمان مربوط می باشد. با توجه به پیشرفت های روزافزون درباره ی بیومارکرها و کشف تعداد بیشتری از آنها نیاز به ایجاد پایگاه داده های جامع می باشد. در این راستا همزمان با پیشرفت بیومارکرها و به علت دشواری روش های آزمایشگاهی، الگوریتم ها و نرم افزارهایی جهت کشف و شناسایی آنها و درنتیجه پیش بینی و درمان بیماری ها ایجاد شده اند. در این پژوهش به بررسی پایگاه های داده، الگوریتم ها و نرم افزارهای موجود که قادر به تشخیص وجود بیماری، میزان پیشرفت آن و اندازه گیری اثربخشی درمان هستند، پرداخته شد. در نهایت نتیجه گیری شد که میتوان به ایجاد الگوریتم هایی برای تعیین ارتباط و پیوستگی بیماری ها با هم اقدام نمود. همچنین از آنجایی که بسیاری از داروها بر پایه متابولیت های ثانویه گیاهان می باشد و عملا در بسیاری از موارد شناسایی و سنتز شیمیایی این متابولیت ها نا ممکن و یا دشوار است، بنابراین یافتن منابع جدید حاوی این متابولیت ها و یا پیش سازهای آن می تواند راهگشا باشد. در این خصوص از پتانسیل بیوانفورماتیک می توان بهره جست و به ایجاد الگوریتم ها و نرم افزارهایی برای تشخیص وجود این نوع متابولیت ها در گیاهان و سایر موجودات اقدام نمود.در این مقاله به ایجاد این قبیل الگوریتم های نوین اشاره شده است .

کلیدواژه ها:

کشف بیومارکر ، پایگاه داده ، الگوریتم ، نرم افزار