روشی نوین برای پیش بینی و ارزیابی miRNA

شناسایی MicroRNA) miRNA ها) و ژنهای هدف آنها نقش مهمی را در درک فعالیت های نظارتی در سلول ایفا میکند. اکثر روش های محاسباتی بر توالی تکمیلی بین miRNA ها و ژنهای هدف بدون استفاده از داده های بیانشده واقعی تمرکز می کنند و حتی زمانی که داده های واقعی مورد استفاده قرار می گیرند، در درجه اول فقط برای اعتبار سنجی رابطه پیش بینی شده بین miRNA های اختصاصی و ژنها بکار می روند. یافته های اخیر نشان دادهاند که هنگام استفاده از روش های مبتنی بر توالی، بسیاری از اهداف از دست رفته اند. در این کار، ما یک روش قوی را برای پیش بینی و ارزیابی جفت ژنهای miRNA بر اساس داده های مکانی بیان شده از توالی نسل بعدی و ریزآرایه های DNA ارایه میکنیم. روش اول از الگوی خوشه بندی mean-K برای گروه بندی miRNA ها و ژنها استفاده میکند و پس از آن جفت های miRNA-genes را به یک گراف دو بخشی برای به دست آوردن نتایج آماری تخصیص می دهد. روش توسط اعتبار سنجی متقابل -10 fold بر روی دو مجموعه داده برای دستیابی به کارایی مناسب تست شده اند.