جدا سازی ژنوتیپ های یک و دو ویروس هپاتیت سی با استفاده از الگوریتم های درخت تصمیم گیری

ویروس هپاتیت سیHCV یک علت عمده بیماری کبدی در سراسر جهان است و عوارض قابل توجه آن علاوه بر ایجاد بیماری های مزمن و اختلال در سلامتی و نهایتا باعث مرگ و میر خواهد شد. دو ژنوتیپ 1 و 2 این ویروس بیشترین همه گیری را داشته و درمان هایرایج برای درمان بیماری هپاتیت سی بسته به نوع ژنوتیپ ویروس متفاوت می باشد. از آنجا که هزینه و طول درمان بر اساس ژنوتیپویروس طراحی می شود پیدا نمودن روشهایی که بتواند ژنوتیپ ویروس را مشخص نماید از اولویت اساسی برخوردار است. مجموعه داده ایی اولیه با 1490 رکورد و 78 ویژگی را با تمیزکردن داده ها به مجموعه پایه ای با 23 ویژگی تقلیل دادیم که با اجرای 10 الگوریتممختلف روی این مجموعه جدید به 10 پایگاه داده ای جدید با تعداد متفاوتی ویژگی دست پیدا کردیم. پژوهش حاضر با هدف تحلیل توالی نوکلئوتیدی ویروس هپاتیت سی به منظور جداسازی ژنوتیپ 1و 2 با استفاده از الگوریتم های درخت تصمیم گیریdecision tree طراحی شده است. نتایج حاصله نشان داد که بهترین پیش بینی در این بررسی توسط مدلDT Gain Ratioبر روی دیتاست FCdb98,46 ) و بدترین آن روی مدلهایDT Stump Accuracy & DT Stump Gain Ratio PCA حاصل شد. برای اولین نشان داده شد که الگوریتم های ایجاد درخت های تصمیم گیری می توانند به عنوان یک ابزار مفید جهت دسته بندی ژنوتیپ های ویروس هپاتیت سی مورد استفاده قرار گیرند

کلیدواژه ها:

هپاتیت سی ، ژنوتیپ 1 ، ژنوتیپ 2 ، درخت تصمیم