شناسایی اینترون گروه II در باکتری های ترموفیل بومی ایران

هدف:باکتریها کارخانههای بیهمتای بیولوژیک در تولید محصولاتزیستفناوری هستند. برخی ویژگیها نظیر تحمل شرایط خاص رشد وتولید آنزیمهای مختلف، باکتریها را جهت تولید و بهره برداری مورد توجهقرار داده است. عدهای از باکتریها واجد عوامل ژنت کیی با قابلیت جابهجاییهستند. از این عوامل میتوان به اینترونهای گروه II اشاره کرد که نه تنهابه کمک آنزیمهایی که کد م کینند، قادر به برش خود هستند، بلکه قادرنددر محل دیگری از ژنوم باکتری جایگزین شوند. اساس این جایگزینی،برقراری پیوند هیدروژنی بین بخش کوچکی از اینترون و توالی مکملآن در جایگاه هدف است. این جابهجایی با مهندسی ژنت کی قابل هدایتمیباشد و از آنجا که قرار دادن توالی خارجی درون اینترون در جابهجاییآن اختلال ایجاد نم کیند، افق روشنی برای ژن درمانی پدیدار میشود. ازسوی دیگر سه آنزیم با ارزشوارونوشتاز , ) reverse transcriptase ( آندونوکلئاز ,) )endonucleaseمچوراز ) maturase (توسط این اینترونها کد میشود. وجود اینترونهایمزبور در باکتریهای ترموفیل، زمینههای بهر هبرداری قابل توجهی را فراهممیآورد. هدف از این پژوهش شناسایی باکتریهای ترموفیل بومی ایران کهدارای اینترون گروه II هستند میباشد.مواد و رو شها: به منظور شناسایی اینترون گروه II ، بخش حفاظت شدهیآن در باکتریها با استفاده از نرمافزارهای بیوانفورمات کی شناسایی و بااستفاده از نرمافزار Gene runner پرایمر اختصاصی طراحی شد. DNAژنومی از باکتری بومی استخراج و PCR در شرایط بهینه انجام گرفت.باکتریهای دارنده اینترون به منظور شناسایی ژن آنزیم ترانسکریپتازمعکوس، با روش PCR مورد بررسی بیشتر قرار گرفتند.نتیجه: دو باکتری ترموفیل بومی جدا شده از چشمههای آب گرم ایران دربررسی اولیه توسط تکن کی PCR واجد اینترون گروه II بودند. در بررسیبعدی وجود ژن trt که رمز کننده آنزیم ترانس کریپتاز معکوس میباشد،در این باکتریها به اثبات رسید.بحث:باکتریهای بومی مورد بررسی میتوانند جهت همسانهسازیcloning( ( ژن trt و تولید آنزیم گرما دوست مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

اینترون گروه II ، باکتری ترموفیل بومی ژن trtreverstranscriptase