شناسایی و تحلیل اپی توپ های سطحی پروتئین ABCB۱ به عنوان کاندیدای بالقوه برای طراحی ایمونوتراپی در سرطان کولورکتال

سرطان کولورکتال یکی از شایع ترین بدخیمی های دستگاه گوارش است و مقاومت دارویی چندگانه از مهم ترین موانع موفقیت درمان در این بیماری به شمار می رود. پروتئین ABCB۱ به عنوان یکی از اجزای کلیدی در ایجاد و تقویت مقاومت دارویی، توجه زیادی را در پژوهش های سرطان به خود جلب کرده است. با این حال، بهره گیری از این پروتئین در رویکردهای نوین درمانی، به ویژه ایمونوتراپی مبتنی بر اپی توپ، هنوز به طور کامل بررسی نشده است. در این مطالعه، با استفاده از تحلیل In-Silico توالی و ساختار سه بعدی ABCB۱، نواحی سطحی و بالقوه آنتی ژنیک پروتئین شناسایی و ارزیابی شدند. ابتدا با بهره گیری از ویژگی های هیدروفوبیسیته و شاخص های فیزیکوشیمیایی، چند ناحیه نامزد اپی توپی استخراج شد. سپس این نواحی بر اساس پایداری، دسترسی سطحی و تناسب ساختاری برای هدف گیری ایمنی مقایسه شدند. نتایج نشان داد که اپی توپ ۸۱–۹۸ در مقایسه با ناحیه ۷۳۰–۷۴۹ از پایداری بیشتری برخوردار بوده و از نظر قرارگیری در سطح پروتئین، گزینه مناسب تری برای شناسایی ایمنی محسوب می شود. بر این اساس، اپی توپ ۸۱–۹۸ می تواند به عنوان یک نامزد امیدوارکننده برای طراحی پپتیدهای ایمونوژنیک در سرطان کولورکتال مطرح شود. یافته های این پژوهش نشان می دهد که تحلیل ساختاری-عملکردی اپی توپ های ABCB۱ می تواند مبنایی برای توسعه رویکردهای هدفمند ایمنی درمانی و طراحی واکسن های پپتیدی در آینده فراهم آورد.

کلیدواژه ها:

سرطان کولورکتال ، ABCB۱ ، اپی توپ ، ایمونوتراپی ، مقاومت دارویی ، واکسن پپتیدی