معرفی و ارزیابی تکثیر نشانگرهای EST-SSR در گیاه آلوروپوس لیتورالیس
محل انتشار: دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,071
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0738
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
چکیده مقاله:
پیشرفت های اخیر در زمینه مطالعات ژنومی، منجر به تولید انبوهی از ترادف بیان شونده ی نشاندار EST) در بسیاری از موجودات، بویژه گونه های گیاهی شده است. در این مطالعه با داده کاوی مجموعه ترادف های EST گزارش شده در ژن بانک NCBI، برای جنس آلوروپوس (Aeluropus)، ترادف های حاوی توالی های تکراری ساده (SSR) شناسایی شدند و در مرحله بعد پس از سنتز پرایمرهای مناسب توانایی تکثیر و ایجاد چندشکلی در برخی از اکوتیپ های گونه لیتورالیس (A.littoralis) ارزیابی شد. نتایج نشان داد که از مجموع EST, 611 مورد بررسی تعداد 44 مورد حاوی نواحی ریزماهواره هستند که از این تعداد در 20 مورد طول و شرایط نواحی مجاور موتیف های SSR برای طراحی پرایمر مناسب تشخیص داده شد. همچنین نتایج بدست آمده از تکثیر جفت پرایمرها با استفاده از DNA ژنومی اکوتیپ های مختلف نشان می دهد که تمامی پرایمرهای طراحی شده توانایی تکثیر در تمام اکتیپ ها ندارند و چند شکلی مشاهده شده در لوکوس های تکثیر شده، بخوبی بر تنوع نواحی عملکردی ژنوم دلالت دارد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
مریم میدانسری
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
قربانعلی نعمت زاده
استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
احسان شکری
کارشناس ارشد اصلاح نباتات، عضو هیئت علمی پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان
حشمت الله رحیمیان
استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :