بررسی چندشکلی ادغامی رتروترنسپوزون های LTR و تنوع ژنتیکی آفتابگردانHelianthus annuus L با استفاده ازنشانگرهای IRAP REMAP

رتروترنسپوزون ها عناصررایج ژنوم گیاهان میباشند فراوانی فعالیت و توزیع مناسب رتروترنسپوزونها درژنوم ها آنها را به یک ابزار مهم مطالعه ژنوم گیاهان تبدیل کرده است به منظوربررسی سطح تنوع ژنتیکی 106 لاین خالص افتابگردان و فعالیت عناصررتروترنسپوزونی ازنشانگرهای REMAP,IRAP استفاده شد نتایج نشان داد که رترونسپوزونها درژنوم افتابگردان فعال هستند و درداخل یکدیگر ودرنواحی نزدیک به ریزماهواره ها ادغام شده اند از42اغازگرمنفرد و ترکیب اغازگری 20اغازگر10اغازگرIRAP و 10اغازگرREMAP قادربهتولید الگوی باندی باوضوح و چندشکلی بالا بودند 20اغازگراستفادهشده درمجموع 201 مکان را تکثیر کرد که ازاین تعداد 172مکان چندشکل بودند اغازگرCR مبتنی بررتروترنسپوزونهای Helicopia LTR به همراه UF مبتنی بررتروترنسپوزون SURE LTR بیشترین و اغازگرمنفرد CF مبتنی بررتروترنسپوزون Helicopia LTR کمترین تعدادمکان های چندشکل را تکثیر کردند تجزیه کلاستر با روش UPGMA و با استفاده ازضرایب تشابه دایس لاین هارا به 8گروه تقسیم کرد بیشترین مقدارتشابه ژنتیکی 0/93 بین لاینهای TMB51 HA335B و کمترین مقدارتشابه ژنتیکی 0/34 بین لاین های F1250/03 11*12 بود مقدارمتوسط تشابه ژنتیکی 0/68 بود

کلیدواژه ها:

رتروترنسپوزون ، IRAP ، REMAP ، LTR