بررسی تنوع ژنتیکی Cauliflower mosaic virus در شمال شرق ایران

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 723

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AGRIBIOTECH03_289

تاریخ نمایه سازی: 27 تیر 1392

چکیده مقاله:

ویروس موزائیک کلم گل Cauliflower mosaic virus-CaMV یکی از مخرب ترین ویروس های خانواده کروسیفر خصوصا در کلم گل در نقاط مختلف جهان می باشد. در بررسی های انجام شده از مناطق عمده کاشت کلم گل در استان های خراسان رضوی و شمالی در تابستان سال های 1390 - 1389 در برخی از بوته ها علائم رگبرگ روشنی، رگبرگ نواری، موزائیک و بدشکلی مشاهده شد. در ابتدا جهت بررسی آلودگی، از آزمون سرولوژیکی DAS-ELISA استفاده شد. سپس به منظور تائید آلودگی نمونه ها DNA کل با استفاده از بافر CTAB استخراج شد. در آزمون PCRکه با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی CMIb-F1/CMIb-R1 انجام شد، قطعه ای به طول تقریبی 1500 جفت باز مربوط به ژن 6 ویروسی ORF VI تکثیر گردید. این ژن در مقایسه با دیگر ژن های CaMV بیشترین تنوع Variation) را نشان داده است. تعیین ترادف نوکلئوتیدی نمونه ها توسط شرکت ماکروژن کره انجام شد و ترادف های حاصل با سایر ترادف های موجود در بانک ژن مقایسه شدند. رسم درخت فیلوژنی برای ORF VI ویروسی با استفاده از نرم افزار MEGA5 و بکارگیری روش Neighbour joining انجام شد. همچنین همردیف سازی ترادف های حاصل با استفاده از نرم افزار DNAMAN نشان داد که جدایه های ایرانی بیشترین شباهت را با جدایه ای از چین(NC:AF 140604 ) به میزان 98 % در سطح نوکلئوتیدی و 99 % در سطح آمینواسیدی دارا می باشند. بر اساس تجزیه تبارزایی، جدایه های ایرانی مورد مطالعه در گروه جدایه های غیر آمریکای شمالی و در یک شاخه قرار گرفتند.

کلیدواژه ها:

ویروس موزائیک کلم گل PCR ، DAS-ELISA ، ORF VI

نویسندگان

آزاده انتظاری

دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی - گروه گیاهپزشکی، دانشکده کش

بهروز جعفرپور

استاد گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

محسن مهرور

استاد گروه گیاهپزشکی ، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Clark, M.F., and Adams, A.N. 1977. Characteristics of the microplate ...
  • Farzadfar, S.H., Ahoonmanesh, A., Mosahebi, G.H., Ohshima, K., Koohi-Habibi, M., ...
  • Hoh, F., Uzest, _ Drucker, M., Plisson- Chastang, C., Bron, ...
  • Shahraeen, N. 2012. An overview of oilseed rape (Canola) virus ...
  • Spence N.J., Phiri N.A., Hughes S.L, , Mwaniki A., Simons ...
  • Tompkins, C.M. 1937. A transmissibe mosaic disease of Cauliflower Journal ...
  • Woolston C.J., Covey S.N., Penswick J.R., and Davies J.W. Aphid ...
  • نمایش کامل مراجع