Transcriptome analysis of tobacco in response to Ralstonia solanacearum infection

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 118

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCP-5-4_012

تاریخ نمایه سازی: 13 آبان 1402

چکیده مقاله:

One of the best strategies to control bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum (Smith) is generally based on breeding resistant cultivars. The information obtained from the expression of plant defense genes will provide new insight for improving plant resistance against pathogens. This study was to identify inducible genes under defense no death (DND) reaction of tobacco (Nicotiana tabacum)-R. solanacearum interaction using cDNA-AFLP technique. In this assay five different primer combinations were used. Out of ۱۳۲۰ Transcript derived fragments (TDF) that were detected, ۱۰۱ fragments were identified as differentially expressed genes in ۰, ۲۴, ۴۸ and ۷۲ hours post inoculation. Most of the differentially expressed genes were obtained ۴۸ hours post inoculation. Following sequencing, most of sequenced TDFs showed homology to known genes interfering in signaling, regulation and defense functions. DND phenotype in tobacco has some similarities specially in signaling process with mechanism associated with induction of the hypersensitive reaction and it is distinct from general defense mechanisms.

نویسندگان

Cobra Moslemkhani

Seed and Plant Certification and Registration Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran.

Javad Mozafari

Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran.

Masoud Shams-Bakhsh

Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran.

Ebrahim Mohamadi Goltape

Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Bachem, C. W. B., Oomen, R. J. F. and Visser, ...
  • Bassam, B. J., Caetano-Anolle´s, G. and Gresshoff, P. M. ۱۹۹۱. ...
  • Baulcombe, D. C. ۱۹۹۹. Fast forward genetics based on virus-induced ...
  • Bohlmann, J., Meyer-Gauen, G. and Croteau, R. ۱۹۹۸. Plant terpenoid ...
  • Buddenhagen, I. and Kelman, A. ۱۹۶۴. Biological and physiological aspects ...
  • Carney, B. F. and Denny, T. P. ۱۹۹۰. Acloned avirulence ...
  • Carputo, D. and Barone, A. ۲۰۰۵. Ploidy level manipulations in ...
  • Carputo, D., Aversano, R., Barone, A., Di Matteo, A., Iorizzo, ...
  • Chen, X., Goodwin, S. M., Boroff, V. L., Liu, X. ...
  • Dahal, D., Heinz, D., Dorsselaer, A. V., Braun, H. P. ...
  • Daurelio, L., Tondo, M. L., Dunger, G., Gottig, N., Ottado, ...
  • Daurelio, L. D., Checa, K., Barrio, J. M., Ottado, J. ...
  • de Pinto, M.C., Paradiso, A., Leonetti, P. and De Gara, ...
  • Dorothea, T., F. Chen, J. Petri, J. Gershenzon, and Pichersky, ...
  • Esposito, N., Ovchinnikova, O. G., Barone, A., Zoina, A., Holst, ...
  • Facchini, P. J. and Chappell, J. ۱۹۹۲. Gene family for ...
  • Gao, G., Jin, L. P., Xie, K. Y. and Qu, ...
  • Godiard, L., Ragueh, F., Froissard, D., Leguay, J. J., Grosset, ...
  • Hayward, A. C. ۱۹۹۱. Biology and epidemiology of bacterial wilt ...
  • Ishihara, T., Mitsuhara, I., Takahashi, H. and Nakaho, K. ۲۰۱۲. ...
  • Jakobek, J. L. and Lindgren, P. B. ۱۹۹۳. Generalised induction ...
  • Jaspers, P., Brosché, M., Overmyer, K. and Kangasjrvi, J. ۲۰۱۰. ...
  • Jenks, M. A., Joly, R. J., Peters, P. J., Rich, ...
  • Kamoun, S. ۲۰۰۱. Nonhost resistance to Phytophthora: novel prospects for ...
  • Kessler, A. and Baldwin, I. T. ۲۰۰۱. Defensive function of ...
  • Kiba, A., Maimbo, M., Kanda, A., Tomiyama, H., Ohnishi, K. ...
  • Klement, Z. ۱۹۸۲. Hypersensitivity, In: Mount, M. S. and Lacy, ...
  • Klement, Z., Bozsó, Z., Kecskés, M. L., Besenyei, E., Czelleng, ...
  • Lozano, J. C., and Sequeira, L. ۱۹۷۰. Prevention of the ...
  • Mahalingam, R., Gomez-Buitrago, A. M., Eckardt, N., Shah, N., Guevara-Garcia, ...
  • Marchler-Bauer, A., Anderson, J. B., Chitsaz, F., Derbyshire, M. K., ...
  • Mittler, R., Freng, X. and Cohen, M. ۱۹۹۸. Post-Transcriptional Suppression ...
  • Mittler, R., Vanderauwera, S., Gollery, M. and Van Breusegem, F. ...
  • Narusaka, M., Kubo, Y., Hatakeyama, K., Imamura, J., Ezura, H. ...
  • Nouri, S., Bahar, M. and Fegan, M. ۲۰۰۹. Diversity of ...
  • OEPP/ EPPO. ۱۹۹۰. EPPO Standards PM ۳/ ۲۶. Ralstonia solanacearum, ...
  • OEPP/EPPO. ۲۰۰۴. Diagnostics protocols for regulated pests. Ralstonia solanacearum. Bulletin ...
  • Overmyer, K., Tuominen, H., Kettunen, R., Betz, C., Langebartels, C., ...
  • Overmyer, K., Tuominen, H., Kettunen, R., Betz, C., Langebartels, C., ...
  • Qin, Y. M., Hu, C. Y. and Zhu, Y. X. ...
  • Riederer, M. ۲۰۰۶. Biology of the plant cuticle, In: Riederer, ...
  • Rowland, O., Ludwig, A. A., Merrick, C. J., Baillieul, F., ...
  • Sarowar, S., Kim, Y. J., Kim, E. N., Kim, K. ...
  • Schacht, T., Unger, C., Pich, A. and Wydra, K. ۲۰۱۱. ...
  • Thordal-Christensen, H. ۲۰۰۳. Fresh insights into processes of non-host resistance. ...
  • Vasse, J., Frey, P. and Trigalet, A. ۱۹۹۵. Microscopic studies ...
  • Bachem, C. W. B., Oomen, R. J. F. and Visser, ...
  • Bassam, B. J., Caetano-Anolle´s, G. and Gresshoff, P. M. ۱۹۹۱. ...
  • Baulcombe, D. C. ۱۹۹۹. Fast forward genetics based on virus-induced ...
  • Bohlmann, J., Meyer-Gauen, G. and Croteau, R. ۱۹۹۸. Plant terpenoid ...
  • Buddenhagen, I. and Kelman, A. ۱۹۶۴. Biological and physiological aspects ...
  • Carney, B. F. and Denny, T. P. ۱۹۹۰. Acloned avirulence ...
  • Carputo, D. and Barone, A. ۲۰۰۵. Ploidy level manipulations in ...
  • Carputo, D., Aversano, R., Barone, A., Di Matteo, A., Iorizzo, ...
  • Chen, X., Goodwin, S. M., Boroff, V. L., Liu, X. ...
  • Dahal, D., Heinz, D., Dorsselaer, A. V., Braun, H. P. ...
  • Daurelio, L., Tondo, M. L., Dunger, G., Gottig, N., Ottado, ...
  • Daurelio, L. D., Checa, K., Barrio, J. M., Ottado, J. ...
  • de Pinto, M.C., Paradiso, A., Leonetti, P. and De Gara, ...
  • Dorothea, T., F. Chen, J. Petri, J. Gershenzon, and Pichersky, ...
  • Esposito, N., Ovchinnikova, O. G., Barone, A., Zoina, A., Holst, ...
  • Facchini, P. J. and Chappell, J. ۱۹۹۲. Gene family for ...
  • Gao, G., Jin, L. P., Xie, K. Y. and Qu, ...
  • Godiard, L., Ragueh, F., Froissard, D., Leguay, J. J., Grosset, ...
  • Hayward, A. C. ۱۹۹۱. Biology and epidemiology of bacterial wilt ...
  • Ishihara, T., Mitsuhara, I., Takahashi, H. and Nakaho, K. ۲۰۱۲. ...
  • Jakobek, J. L. and Lindgren, P. B. ۱۹۹۳. Generalised induction ...
  • Jaspers, P., Brosché, M., Overmyer, K. and Kangasjrvi, J. ۲۰۱۰. ...
  • Jenks, M. A., Joly, R. J., Peters, P. J., Rich, ...
  • Kamoun, S. ۲۰۰۱. Nonhost resistance to Phytophthora: novel prospects for ...
  • Kessler, A. and Baldwin, I. T. ۲۰۰۱. Defensive function of ...
  • Kiba, A., Maimbo, M., Kanda, A., Tomiyama, H., Ohnishi, K. ...
  • Klement, Z. ۱۹۸۲. Hypersensitivity, In: Mount, M. S. and Lacy, ...
  • Klement, Z., Bozsó, Z., Kecskés, M. L., Besenyei, E., Czelleng, ...
  • Lozano, J. C., and Sequeira, L. ۱۹۷۰. Prevention of the ...
  • Mahalingam, R., Gomez-Buitrago, A. M., Eckardt, N., Shah, N., Guevara-Garcia, ...
  • Marchler-Bauer, A., Anderson, J. B., Chitsaz, F., Derbyshire, M. K., ...
  • Mittler, R., Freng, X. and Cohen, M. ۱۹۹۸. Post-Transcriptional Suppression ...
  • Mittler, R., Vanderauwera, S., Gollery, M. and Van Breusegem, F. ...
  • Narusaka, M., Kubo, Y., Hatakeyama, K., Imamura, J., Ezura, H. ...
  • Nouri, S., Bahar, M. and Fegan, M. ۲۰۰۹. Diversity of ...
  • OEPP/ EPPO. ۱۹۹۰. EPPO Standards PM ۳/ ۲۶. Ralstonia solanacearum, ...
  • OEPP/EPPO. ۲۰۰۴. Diagnostics protocols for regulated pests. Ralstonia solanacearum. Bulletin ...
  • Overmyer, K., Tuominen, H., Kettunen, R., Betz, C., Langebartels, C., ...
  • Overmyer, K., Tuominen, H., Kettunen, R., Betz, C., Langebartels, C., ...
  • Qin, Y. M., Hu, C. Y. and Zhu, Y. X. ...
  • Riederer, M. ۲۰۰۶. Biology of the plant cuticle, In: Riederer, ...
  • Rowland, O., Ludwig, A. A., Merrick, C. J., Baillieul, F., ...
  • Sarowar, S., Kim, Y. J., Kim, E. N., Kim, K. ...
  • Schacht, T., Unger, C., Pich, A. and Wydra, K. ۲۰۱۱. ...
  • Thordal-Christensen, H. ۲۰۰۳. Fresh insights into processes of non-host resistance. ...
  • Vasse, J., Frey, P. and Trigalet, A. ۱۹۹۵. Microscopic studies ...
  • نمایش کامل مراجع