کاربرد روش DGGE در مطالعه تنوع میکروبی خاک
سال انتشار: 1389
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 2,743
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NSBDIAE01_034
تاریخ نمایه سازی: 9 شهریور 1391
چکیده مقاله:
در مطالعات اکولوژی میکروبی، روشهای متکی به کشت میکروبی جهت شناخت تنوع میکروبی خاک، کارائی چندانی ندارند زیرا تنها بخش اندکی از میکروارگانیسمها را میتوان با استفاده از کشت بدست آورد. به همین دلیل نیاز استروشهای نسبتاً جدید مطالعه جوامع میکروبی خاک مورد ارزیابی قرار گیرند. امروزه روشهای متعددی برای تعیین ساختار جوامع میکروبی بر اساس تکنیکهای مولکولی به کار میرود. از جمله این روشها استفاده ازDGGE است. این روش برپایه استفاده از تنوع در توالی نوکلئوتیدی ژنهایS rRNA 16 و S rRNA18 متمرکز است. استراتژی کلی برای بررسیژنتیکی جوامع میکروبی خاک شامل استخراج اسیدهای نوکلئیک و سپس تکثیر فراوان ژنهای کد کننده 18S 16 یا S rRNA rRNA و سپس آنالیز ژنهای تکثیر شده همراه با نمونه شاهد با استفاده از یکی از تکنیکهای ژنتیکی مانندDGGEاست. جداسازی قطعاتDNA درDGGE بر اساس کاهش تحرک الکتریکی مولکولها در ژل پلی آکریلامید است. مولکولهایی با توالی نوکلئوتیدی مختلف ممکن است رفتار متفاوتی در سرتاسر ژل داشته باشند که در نتیجه آن در موقعیتهای متفاوتی از ژل حرکت کرده رسوب میکنند
کلیدواژه ها:
نویسندگان
جلال جلیلیان
استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :