همردیفی ژنتیکی برخی ارقام و لاین های موتانت برنج با استفاده از نشانگرهای ITS

در این پژوهش جهت ارزیابی تفاوت و تشابه ژنتیکی (همردیفی ژنتیکی) ارقام و لاینهای موتانت حاصل از پرتودهی اشعهگاما، رقم سپیدرود و ۳ لاین موتانت حاصل از آن و رقم نعمت به همراه رقم روشن حاصل از پرتودهی رقم نعمت با استفادهاز نشانگرهای ITS مورد ارزیابی قرار گرفتند. پس از استخراج DNA ژنومی ارقام مورد مطالعه با استفاده از روش تغییر یافتهدلاپورتا، مواد ژنتیکی با استفاده از ۳ آغازگر ITS توسط واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) تکثیر شده و پس از خالصسازیبه منظور توالی یابی ارسال گردید. در نهایت توالی های بدست آمده جهت ارزیابی تفاوت و تشابه ژنتیکی ارقام و لاین هایموتانت حاصل، توسط نرم افزار bioedit با یکدیگر همردیف گردیدند. نتایج حاصل نشان میدهد که با استفاده از نشانگر A(SSR-F/۵.۸S-R)، والد سپیدرود و موتانت سپیدرود ۱۰۰ ٪ تشابه را نشان داد و والد سپیدرود با مینیاتور ۲ (تفاوت در ۲نوکلئوتید) و با مینیاتور ۶ (تفاوت در یک نوکلئوتید) تشابه بالایی دارد. نشانگر LSR-R/۵.۸S-F)B)، تفاوت زیادی بین توالیهای والد سپیدرود با مینیاتور ۲ نشان داد اما نتیجه برای والد سپیدرود و مینیاتور ۶ (تفاوت در ۴ نوکلئوتید) با استفاده از ایننشانگر تایید کننده تشابه بالا بین والد و موتانت حاصل میباشد. همچنین نتیجه همردیفی برای والد نعمت و رقم روشن،تشابه کامل توالیها بود.میتوان با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی (Alignment)، تمایز و تشابه بین والدین و لاین هایموتانت را نشان داد.

کلیدواژه ها:

لاین های موتانت برنج ، همردیفی ژنتیکی ، نشانگرهای ITS