ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های گندم با استفاده از نشانگرهای AFLP

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 166

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCB-7-16_011

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400

چکیده مقاله:

تنوع ژنتیکی ۴۵ رقم گندم با استفاده از نشانگرهای چند شکلی طول قطعات تکثیر یافته  (AFLP) بررسی شد. از یازده ترکیب آغازگر PstI و Mse۱ برای بررسی چند شکلی­ AFLP، شش ترکیب آغازگر (P-CGA/M-CTA، P-ATG/M-CTG، P-ATG/M-CAT، P-AGT/M-CTA، P-AGT/M-CAG و P-ATG/M-CAG) نوارهای چند شکل تولید کردند. در مجموع ۳۲۸ نوار به­دست آمد که از بین آنها ۲۰۷ نوار (۱۰/۶۳%) در بین ژنوتیپ­ها چند شکل بود که نشان­دهنده درصد بالای چند شکلی در بین ژنوتیپ­ها است. میزان اطلاعات چند شکلی (PIC) بین ۳۹/۰ در آغازگر P-AGT/M-CAG تا ۴۴/۰ در آغازگر P-ATG/M-CTG متغیر بود. بر طبق شاخص تنوع ژنی نی و شاخص اطلاعات شانون، بیشترین و کمترین تنوع ژنتیکی درون ژنوتیپ­ها بر اساس ترکیبات آغازگر در P-ATG/MM-CAT و P-CGA/M-CTA به­دست آمد. تجزیه کلاستر بر اساس روش دورترین همسایه­ها۱ و با استفاده از فاصله ژنتیکی نی ژنوتیپ­ها را به شش گروه طبقه­بندی کرد. بیشترین تعداد ژنوتیپ­ها در کلاستر ششم (۸۶/۴۱%) و کمترین آنها در کلاستر چهارم (۶۵/۴%) قرار گرفتند. دامنه تشابه بر اساس ضریب تشابه دایس از ۵۷/۰ تا ۹۹/۰ متغیر بود. دو ژنوتیپ آرتا و قدس بیشترین تشابه ژنتیکی  (۹۹/۰) و دو ژنوتیپ آزادی و کوهدشت  کمترین شباهت (۵۶۹/۰) را با سایر ژنوتیپ­ها داشتند.

کلیدواژه ها:

Polymorphism ، Cluster Analysis ، PCoA ، چندشکلی ، تجزیه خوشه ای ، تجزیه به بردارهای اصلی

نویسندگان

بابک صارمی راد

دانشگاه محقق اردبیلی

مجید شکرپور

دانشگاه تهران

امید سفالیان

دانشگاه محقق اردبیلی

علیرضا پورمحمد

دانشگاه مراغه

عزت اله اسفندیاری

دانشگاه مراغه

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Al-Saghir, M.G., H. Malkawi and A. El-Oqlah. ۲۰۰۷. Genetic diversity ...
  • Kraakman, A.T.W., F. Martinez, B Mussiraliev, F.A. Van Eeuwijk and ...
  • Kraakman, A.T.W., R.E. Niks, P.M.M.M. Van den Berg, P. Stam ...
  • Manly B.F.J. ۲۰۰۵. Multivariate Statistical Methods: A Primer .۲nd edition. ...
  • Naghavi, M.R., M. Malaki, H. Alizadeh, M. Pirseiedi and M. ...
  • Nei, M. ۱۹۷۳. Analysis of genetic diversity in subdivided populations. ...
  • Paakniat, H. ۲۰۱۰. Introduction to Plant Breeding. Shiraz University Publications. ...
  • Rao, N.K. ۲۰۰۴. Plant genetic resources: Advancing conservation use through ...
  • Russell, J.R., J.D. Fuller, M. Macaulay, B.G. Hatz, A. Jahoor, ...
  • Saghai-Maroof, M.A., K. Soliman, R.A. Jorgensen and R.W. Allard. ۱۹۸۴. ...
  • Vos, P., R. Hogers, M. Bleeker, M. Reijans, D.L. Theovan ...
  • نمایش کامل مراجع