آنالیز ناحیه پروموتری ژن مربوط به آنزیم beta-amyrin synthaseدر گیاهEutrema salsugineum

گروهی از آنزیم های مهم کاتالیز کننده در مسیر بیوسنتز ساپونین تری ترپنوییدها، اکسیدو اسکوالن سیکلازها می باشند که آنزیم بتا آمیرین سنتاز از جمله این آنزیم ها است. در مطالعه حاضر توالی ژنومی مربوط به آنزیم beta-amyrin synthase با استفاده از بانک اطلاعاتی Phytozome در مورد گیاه Eutrema salsugineum یافت شد. آنالیز ناحیه پروموتری در 1500 جفت باز بالادست ژن مورد نظر در این گیاه نشان داد که تعداد متنوعی عناصر تنظیمی با نقش های متفاوت در پروموتر این ژن وجود دارند که نشان دهنده نقش آنها در مسیرهای مختلف فیزیولوژیک در گیاه می باشد. عمده ترین عنصر تنظیمی در این گیاه TATA-box است که به تعداد 55 عدد می باشد که به عنوان core promoter فعال می باشد. بعد از آن موتیف CAAT-box می باشد که به تعداد 27 عدد بوده و به عنوان عناصر تنظیم کننده تقویت کنندگی و افزایش دهندگی ژنی می باشد و در نوبت بعد موتیف Skn-1_motif می باشد که به تعداد 4 عدد بوده و عناصر تنظیمی فعال کننده سیس مورد نیاز برای بیان آندوسپرم می باشند. با توجه به نتایج، آنالیز ناحیه پروموتری این ژن بیانگر این است که اکثر موتیف های شناسایی شده در این گیاه به عنوان عناصر پاسخ دهنده به واکنش های نوری عمل می کنند. بنابراین واضح است، عمده فاکتورهای رونویسی که به این موتیف ها اتصال می یابند، درگیر در واکنش های نوری و فتوسنتزی خواهند بود. جداسازی پروموتر این ژن و استفاده از آن در تولید گیاهان تراریخت مقاوم به تنش های زیستی و غیر زیستی می تواند مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

آنالیز پروموتر ، بیوانفورماتیک ، β-آمیرین سینتاز ، Eutrema salsugineum