ردیابی مولکولی و بررسی فیلوژنتیکی جدایه های ویروس موزائیک معمولی لوبیا از مزارع لوبیا استان زنجان

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 252

نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

PPC01_142

تاریخ نمایه سازی: 23 مهر 1398

چکیده مقاله:

ویروس موزائیک معمولی لوبیا ( Bean common mosaic virus, BCMV )، به جنس Potyvirus از خانواده Potyviridae تعلق دارد. این ویروس از مهمترین عوامل ایجاد بیماری و کاهش عملکرد در مزارع لوبیا در سراسر جهان بوده که می تواند به صورت منفرد و یا آلودگی مخلوط با ویروس موزائیک زرد لوبیا و یا سایر پوتی ویروسهای لوبیا همراه شوند. هدف از این مطالعه، ردیابی مولکولی و بررسی فیلوژنتیکی چند جدایه BCMV در مزارع لوبیا استان زنجان بود. به منظور ردیابی این بیماری، نمونه برداری انتخابی از گیاهان دارای علائم موزائیک، ابلقی، بدشکلی، عدم تقارن و سبزردی در سال زراعی 97- 98 از مزارع لوبیا شهرستانهای قیدار، ابهر و سلطانیه در استان زنجان انجام شد. از بافتهای برگی مشکوک جمع آوری شده آر ان ای کل استخراج و سپس دی ان ای مکمل با استفاده از Oligo dt16 و کیت ساخت (Hyperscript) cDNA شرکت GeneAll تکثیر شد. از واکنش زنجیرهای پلیمراز با استفاده از دو جفت آغازگر اختصاصی BCMVCpF وBCMVCpR تکثیر کننده ناحیه های ژن پروتئین پوششی و NIb برای ردیابی ویروس موزائیک معمولی لوبیا استفاده شد. واکنش زنجیرهای پلیمراز قطعهای بهاندازه حدود 500 جفت باز را در نمونه های مشکوک تکثیر نمود. تعیین توالی نوکلئوتیدی قطعات تکثیر یافته به صورت یک طرفه با استفاده از آغازگر مستقیم توسط شرکت بیونیر کره جنوبی انجام شد. مقایسه توالیهای به دست آمده با توالیهای موجود در بانک ژن نشان داد که قطعه تکثیر شده مربوط به ویروس موزائیک معمولی لوبیا است. تجزیه و تحلیل تبارزایی جدایه های ردیابی شده با استفاده از نرم افزار Mega X و روش Neighbor Joining نشان داد که جدایه های ردیابی شده با جدایه هایی که قبلا از ایران گزارش شده اند (دو جدایه Ir-S31 و (Ir-D7 و در یک گروه قرار دارند. درصد تشابه با جدایه های ایرانی ویروس موزاییک معمولی لوبیا بین 97 تا 99 درصد بود. آنالیز جمعیت جدایه های جدید و ایرانی و سایر جدایه ها انجام شد که نرخ جهش ها نشان دهنده انتخاب مثبت در جمعیت ایرانی این ویروس بود. لازم به ذکر است آلودگی مخلوط این جدایه ها با ویروس موزائیک زرد لوبیا نیز بررسی شد و برخی از جدایه ها دارای آلودکی همزمان ویروس موزاییک معمولی لوبیا و ویروس موزائیک زرد لوبیا بوند.

نویسندگان

الهه جمالی

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران

داود کولیوند

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران

رحیم احمدوند

موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج

امید عینی گندمانی

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران