استفاده از الگوریتم های SOM و Fuzzy C-means در وراثت موجودات
سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 449
فایل این مقاله در 18 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CITCOMP03_213
تاریخ نمایه سازی: 31 اردیبهشت 1398
چکیده مقاله:
بررسی اختلافات ژنتیکی بین انسان ها گواه این است که جهش در توالی DNA باعث بیماریهای ژنتیکی زیادی می شود.بنابراین بکمک توالی کامل ژنوم که برای انسان ها و موجودات دیگر در دسترس می باشد ، بررسی اختلافات ژنتیکی یا پلی مورفیسم ، مسیله مهمی می باشد . برای بازسازی جفتی از هاپلوتایپ ها از مقادیر SNPموجود در توالی DNA از اسمبلی هاپلوتایپ استفاده می شود . استنتاج هاپلوتایپها از طرق آزمایشگاهی موجب تحمل هزینه های مالی و زمانی هنگفت است ، از اینرو بازسازی آنها از قطعات SNP، توسط روشهای محاسباتی در کانون توجه محققان محاسبات مولکولی می باشد . کار ما بر روی مسیله بازسازی هاپلوتایپ ها از یک فرد خاص می باشد . بازسازی هاپلوتایپ ها ، ساختن هاپلوتایپهای یک فرد از بین قطعات SNP آن فرد می باشد . به این منظور ، در ابتدا از روی کروموزوم ها چند نسخه ایجاد نموده ، سپس کروموزوم ها قطعه قطعه می شود و از روی قطعات ، SNPها مشخص می شوند و مقادیر آنها بصورت یک ماتریس نمایش داده می شود . در نهایت هاپلوتایپ ها از روی ماتریس حاصل ، با استفاده از روش های محاسباتی و الگوریتمی بدست می آیند . متناسب اشتباهی که در داده های مسیله رخ می دهد مدلهای حل گوناگونی از جمله MEC ، MFR ،MSR ،MCIH و WMLF برای این مسیله ارایه شده است . ما بر روی مطالعه مدل MEC برای مسیله اسمبلی هاپلوتایپ تمرکز می کنیم و روش SOM و Fuzzy C-means را جهت حل این مسیله ارزیابی می کنیم .
کلیدواژه ها:
نویسندگان
آزاده تقوی
گروه کامپیوتر، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه پیام نورتهران
امیرحسین فرقانی
استادیارگروه زیستشناسی، دانشکده علوم، دانشگاه پیام نورتهران
محمدهادی معظم
استادیارگروه برق، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه پیام نورتهران