بررسی و امکان سنجی حضور میکرو RNA های جدید در ناحیه ژنومی تکثیر شده

سرطان جزو اصلی ترین عوامل مرگ و میر در کشورهای توسعه یافته و دومین عامل، در کشورهای در حال توسعه است. در این بین، سرطان ریه اولین دلیل مرگ و میر ناشی از سرطان در جهان می باشد در ایران، سرطان ریه جزو پنج سرطان شایع بوده که نرخ ابتلا به آن در سال های اخیر افزایش یافته است. با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی متعدد، ما نواحی حفاظت شده در ساب باند 3q26.33 را برای یافتن ساختارهای سنجاق سری که مشخصه پیش سازهای miRNA است، جستجو کردیم . با توجه به امتیازهای بدست امده توسط نرم افزارها، ما سه ساختار سنجاق سری را برای تایید تجربی انتخاب کردیم. از بین سه ساختار سنجاق سری انتخاب شده، یکی از انها بنام AMIR-4 بیان اندوژنوس ان توسط PCR شناسایی شد و تعیین توالی صحت وجود این miRNA را تایید کرد. ترانسفکشن سلول های SW480 با وکتور بیانی حامل پیش ساز این miRNA منجر به بیش بیانی فرم بالغ AMIR-4گردید که بیانگر واقعی بودن این miRNA است. از نرم افزار Lab DIANA برای پیش بینی اهداف ژنی AMIR-4 استفاده گردید. نتایج Real-time PCR در سلول های SW480 ترانسفکت شده با حامل بیان کننده AMIR-4 نشان داد که بیان دو ژن APPL1 و TrkC در سطح معنی داری کاهش یافته است.

کلیدواژه ها:

سرطان ریه ، microRNA ، بیوانفورماتیک