انتشار فیلوژنتیکی جدا یه های اشریشیاکلی از لاشه شتر های ذبح شده

اشریشاکلی باکتری گرم منفی است که بصورت طبیعی در دستگاه گوارشی دامهای سالم همچنین محیط اطرافی دامها پرندگان حضور دارد. این باکتری غالبا از طریق مدفوع دامهای سالم در محیط منتشر شده باعث آلودگی مواد غذایی یا آب مورد مصرف دامها انسان می گردد. گرچه تاکنون حضور همه پاتوتایپ های اشریشاکلی در مدفوع شتر به اثبات نرسیده است اما دستگاه گوارشی محیط اطرافی شتر نیز آلوده به باکتری اشریشیاکلی است امروزه بررسی فیلوژنیتکی سویه های اشریشیاکلی به روش PCR در قالب ژنوتایپینگ سویه های جدا شده بر اساس دسته بندی آنها در گروه ها تحت گروههای فیلوژنتیکی انجام می گیرد که بواسطه تعیین حضور ژنهای chuA، yjaA TSPE4.C2 امکانپذیر می گردد که بر این اساس سویه های اشریشیاکلی در چهار گروه اصلی فیلوژنی ,A, B1, B2 وD هفت تحت گروه فیلوژنی (A0,A1,B1,B2-1,B2-2,D1,D2)قرار می گیرند در این بررسی از 59 لاشه شتر سالم ذبح شده در کشتارگاه رفسنجان نمونه های باکتریولوژیک به روش سوآب کشی تهیه شده در محیط های مناسب جهت جداسازی اشریشیاکلی کشت داده شدند. از هر نمونه 3-2 کلنی انتخاب با استفاده از آزمایشات بیوشیمیایی تایید شد در محیط لوریا برتانی براث در حضور 30درصد گلیسرول ذخیره گردید. DNA از هر جدایه به روش لیز اسخراج شده با روش مولتی پلکس PCR مورد بررسی قرار گرفت. بر اساس نتایج از مجموع نمونه های مورد بررسی، 47/45 درصد از جدایه ها در گروه B1، 38/3 درصد در گروه A، 16/10 درصد در گروه D، 98/38درصد در گروه B2 قرار گرفتند. فراوانی جدایه ها در تحت گروه های فیلوژنتیکی نیز بصورت زیر بود A0، A1، D1 D2 بترتیب 1/69%، 1/69%، 1/69% 8/47% تعیین گردید.

کلیدواژه ها:

اشریشیاکلی ، فیلوژنتیک