بررسی گروه های فیلوژنی گونه های اشرشیا کلی جدا شده از سواحل خلیج فارس در بوشهر بر اساس روش جدید فیلوتایپینگ کلرمونت

در سال 2013 کلرمونت، بر اساس روش جدید واکنش زنجیره ای پلیمراز چهارگانه 1 گونه های اشرشیا کلی را به هشت گروه A(و BوCو Dو Eو Fو Clade و Unknown ( فیلوژنی طبقه بندی کرد.بر اساس این طبقه بندی گروه های بیماریزا عمدتا متعلق به گروه های )B2 و) D و بیشترین گونه های مدفوعی متعلق به گروه های A(و) B1 هستند. هدف از این مطالعه شناسایی فیلوژنی اشرشیا کلی بر اساس روش کلرمونت و بررسی الگوی مقاومت آنهاست. در این مطالعه از نواحی مختلف سواحل بوشهر نمونه برداری صورت گرفت و 120 سویه اشرشیا کلی جداسازی شد. در مرحله بعد گروه های فیلوژنی آن بر اساس روش واکنش زنجیره ای پلیمراز چهارگانه و همچنین روش مقاومت دارویی به روش انتشار در دیسک مورد بررسی قرار گرفت. در بین گروه های فیلوژنی نتایج بدست آمده شامل فراوانی های: A )19/16%( ، گروه)% 20 ( Clade I/II )3/33%( ،E )13/3%( ،C )17/5%( ،B2 )2/5%( ، B1 و سویه هایی که در هیچ طبقه بندی فیلوژنی قرار نمی گیرند؛ تحت عنوان گروه های ناشناخته 2 هستند که )% 6/ 21 ( فراوانی را به خود اختصاص دادند. بر اساس آزمایشات انجام شده؛ بیشترین الگوی مقاومت دارویی مربوط به آنتی بیوتیک آمپی سیلین و تتراسایکلین می باشد که در بین گروه های B1 با فراوانی )% 48 / 31 ( مشاهده شد. با توجه به مطالعات صورت گرفته در این پژوهش، مشاهده شد اکثریت گروه های اشرشیا کلی بهگروه فیلوژنی گروه های ناشناخته تعلق داشته و گروه B2 در بین گروه ها کمترین شیوع را دارند. بر اساس تحقیقات انجام شده به روش طبقه بندی جدید کلرمونت مشاهده شد 34 % از سویه های جداشده متعلق به گروه های جدید فیلوژنی: C, E, F و Clade I/II هستند

کلیدواژه ها:

اشرشیا کلی ، روش فیلوتایپینگ کلرمونت ، واکنش زنجیره ای پلیمراز چهارگانه