شناسایی عوامل رونویسی خانواده بزرگ AP2/ERF در گندم نان با استفاده از رویکرد بیوانفورماتیک

گندم نان Triticum aestivum L یکی از مهمترین محصولات زراعی در مناطق قابل کشت جهان است. این گیاه منبع بسیار مهم پروتیین، یکی از مهمترین محصولات زراعی در مناطق قابل کشت جهان است. این گیاه منبع بسیار مهم پروتیین، هستند و در این میان، عوامل رونویسی AP2/ERF که یکی از مهمترین خانواده های تنظیم کنندگان رونویسی است، نقش مهمی در رشد گیاه و پاسخ به تنش های زیستی و غیرزیستی بازی می کنند. در این پژوهش براساس مطالعات بیوانفورماتیک انجام شده، توالی های پروتیینی خانواده بزرگ عوامل رونویسی AP2/ERF از پایگاه های اطلاعاتی محتلف استخراج گردید و حضور ناحیه حفاظت شده AP2 در آنها مورد تایید قرار گرفت. خانواده AP2/ERF بر اساس نواحی اتصال به DNA اختصاصی آنها به چهار گروه طبقه بندی می گردد. توالی های پروتیینی که دارای یک ناحیه AP2 هستند در خانواده ERF اعضایی که دارای دو ناحیه AP2 هستند در خانواده Ap2 و اعضایی که دارای یک ناحیه AP2 و یک ناحیه B3 هستند در خانواده RAV قرار گرفتند. براساس نتایج بدست آمده از جستجو در پایگاه اطلاعات توالی NCBI 159 توالی پروتیینی به ترتیب 129، 25 و 5 عدد و 183 توالی پرویینی بدست آمده از پایگاه Planttfdb به ترتیب 161، 18 و 4 عدد از آنها متعلق به خانواده های AP2 ،ERF و RAV بود.

کلیدواژه ها:

لاتین ، Triticum aestivum ، عامل رونویسی AP2/ERF ، بیوانفورماتیک