بیوانفورماتیک و مروری بر پیش بینی ساختار سوم پروتیین

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,434

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

COMCONF04_017

تاریخ نمایه سازی: 10 تیر 1396

چکیده مقاله:

امروزه استفاده از دانش رایانه در مسایل زیست شناسی مولکولی، منجر به تولد شاخه ی جدیدی به نام زیست انفورماتیک شده است. زیست انفورماتیک یا بیوانفورماتیک دانش استفاده از علوم کامپیوتر و آمار و احتمالات در شاخهزیست شناسی مولکولی است. یکی از زمینه های مهم بیوانفورماتیک پیش بینی ساختار سوم پروتیین می باشد. پروتیین ها مواد آلی بزرگ و یکی از انواع درشت مولکولهای زیستی هستند که از زیرواحدهایی به نام اسید آمینه ساخته و مثل یکزنجیر خطی توسط پیوند پپتیدی 2 بهم متصل شده اند و در مجموع 20 نوع اسید آمینه وجود دارد. این زنجیره در فضای سه بعدی به گونه ای تا می خورد که پایین ترین سطح انرژی را دارد. تعیین ساختار دقیق پروتیین با روش هایآزمایشگاهی به سادگی و در زمانی محدود امکان پذیر نیست. در حالی که تا به حال روش های محاسباتی زیادی از قبیلشبکه های عصبی، روش تکاملی مونت کارلو، روش بهینهسازی ازدحام ذرات، بهینه سازی دسته ی زنبوران و الگوریتم ژنتیک برای حل این مساله در فضاهای دوبعدی و سه بعدی ارایه شده است. دانستن ساختار سوم پروتیین بسیار مهم استچراکه مستقیما به عملکرد آن مرتبط می شود و رفتار سلولی و تمام فعالیت هایی که در سلول انجام می شود بر عهده پروتیین ها است. در این مقاله اهمیت پیش بینی ساختار سوم پروتیین و الگوریتم هایی که برای این منظور مورد استفاده قرار گرفته اند را بطور کلی توضیح خواهیم داد.

کلیدواژه ها:

بیوانفورماتیک ، پیش بینی ساختار سوم پروتیین ، اسید آمینه ، الگوریتم ژنتیک ، مدل آب دوست آب گریز ، شبکه FCC سه بعدی

نویسندگان

زهرا ابوالحسنی فروغی

گروه کامپیوتر، دانشکده مهندسی، واحد مرودشت، دانشگاه آزاد اسلامی، شیراز، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • مهندسی برق و کامپیوتر دی ماه 1395 ...
  • M. A. H. N. Mahmood A Rashid, Md Tamjidul Hoque ...
  • C. M. Dobson, "Principles of protein folding, misfolding and aggregation ...
  • C.-J. L. S.-C. Su, "Protein 3D HP Model Folding Simulation ...
  • M. Aghighi, "A Comparison of Different Lattices in the Protein ...
  • G. E. Dale, C. Oefher, and A. D Arcy, "The ...
  • N. Mansour, F. Kanj, and H. Khachfe, "Particle Swarm optimization ...
  • ]10[Y. G. A. Moussaoui, "Prediction of 3D Protein Structure Using ...
  • ]11[J.-J. T. S.-C. Su, "Ab initio Protein Structure Prediction Based ...
  • ]13[S.-C. S. Jyh-Jong Tsay, "An effective evolutionary algorithm for protein ...
  • نمایش کامل مراجع