مروری جامع بر روشهای محاسباتی تغییرات پس از ترجمه پروتئین

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 2,345

فایل این مقاله در 22 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CRSTCONF01_499

تاریخ نمایه سازی: 27 اسفند 1394

چکیده مقاله:

تغییرات پس ازترجمه پروتئین ازمهمترین فرایندهای شناخته شده درسازماندهی پروتئین های عملکردی هستند و این فرایند درهسته سیتوپلاسم و برخی ازاندامهای سلول اتفاق می افتد طبق مطالعات اخیر انواع تغییرات پس ازترجمه پروتئین ها بیش از500 نوع بیان شده است بطور کلی جهت شناسایی این نوع تغییرات و جایگاه های مربوط به آن ازروشهای ترجبی و همچنین اطلاعات حاصل ازاسپکترونمتری جرمی استفاده میشود اما به دلیل دشواری و پرهزیه بودن این روشها تشخیص انواع تغییرات پس ازترجمه پروتئین ها درابعاد وسیع امکان پذیرنمی باشد لذا درسالهای اخیر استفاده ازروشهای محاسباتی به منظور تعیین تغییرات پس ازترجمه توجه بسیاری ازمحققان را به خود جلب نموده است درروشهای محاسباتی محققین با استفاده از اطلاعات حاصل ازانالیز داده های ترجبی ویژگی های مناسبی ازپروتئین ها را جهت اموزش روشهای یادیگری ماشین وهمچنین جهت پیش بینی تغییرات پس ازترجمه استفاده می کنند

کلیدواژه ها:

نویسندگان

شهین رمضی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوفیزیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران

جواد ظهیری

استادیار، بیوفیزیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران

سیدشهریار عرب

استادیار، بیوفیزیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • (A) _ _ پایخا= حاحع =ععهعیه _ _ بع _ ...
  • د ر حد و د (5000000) جا یگا ه پیشگو ...
  • د ر ا کثر ر و ش ها ی محا ...
  • - RE SID(Garavelli, 2003) _ ...
  • _ Swiss Prot (Farriol-Mathis et al., 2004). http _ //www. ...
  • _ FindMod (Wilkins et al, 1999). ...
  • Allrey, V., Faulkner, R., & Mirsky, A. (1964). Acetylation and ...
  • Alonso, V., & Friedman, P. A. (2013). Minireview: u bi ...
  • Baldi, P., & Brunak, S. (2001). Bioinform atics: the mochine ...
  • Barski, A., Cuddapah, S., Cui, K., Roh, T.-Y., Schones, D. ...
  • Beauclair, G., Bridier-Na hmias, A., Zagury, J.-F., Saib, A., & ...
  • Blom, N., Gammeltoft, S., _ Brunak, S. (1999). Sequence and ...
  • Blom, N., Sicheritz-Po nten, T., Gupta, R., Gammeltoft, S., & ...
  • Bork, P., Dandekar, T., Diaz-Lazcoz, Y., Eisenhaber, F., Huynen, M., ...
  • Caragea, C., Sinapov, J., Silvescu, A., Dobbs, D., & Honavar, ...
  • Cheng, D., _ Shaaban, S., _ Bedford, M. T. (2007). ...
  • Choudhary, C., Kumar, C., Gnad, F., Nielsen, M. L., Rehman, ...
  • Christlet, T. H. T., & Veluraja, K. (2001). Database analysis ...
  • Cooper, C. A., Joshi, H. J., Harrison, M. J., Wilkins, ...
  • Cui, L., & Miao, J. (2010). Ch ro mati n-mediated ...
  • Cundy, T., Hegde, M., Naot, D., Chong, B., King, A., ...
  • Deng, M., Chen, T., & Sun, F. (2004). An integrated ...
  • Diella, F., Cameron, S., Gemiund, C., Linding, R., Via, A., ...
  • Doucey, M.-A., Hess, D., Cacan, R., & Hofsteenge, J. (1998). ...
  • Eisenhaber, B., Bork, P., & Eisenhaber, F. (1999). Prediction of ...
  • Eisenhaber, B., Schneider, G., Wildpaner, M., & Eisenhaber, F. (2004). ...
  • Fa riol-Mathis, N., Garavelli, . S., Boeckmann, B., Duvaud, S, ...
  • Flotho, A., & Melchior, F. (2013). Sumoylation: a regulatory protein ...
  • Garavelli, J. S. (2003). The RESID database of protein modification. ...
  • Gavel, Y., & von Heijne, G. (1990). Sequence differences between ...
  • Grant, P. A. (2001). A tale of histone modification. Genome ...
  • Haglund, K., & Dikic, I. (2005). Ubiquitylation and cell signaling. ...
  • Hart, G. W. (1997). Dynamic O-linked glycosylation of nuclear and ...
  • Hubbard, M. J., & Cohen, P. (1993). On target with ...
  • Kamath, K. S., Vasavada, M. S., & Srivastava, S. (2011). ...
  • Kessler, B. M. (2013). U biq uitin-omics reveals nove networks ...
  • Kolibaba, K. S., & Druker, B. J. (1997). Protein tyrosine ...
  • Krieg, J., Hartmann, S., Vicentini, A., Glasner, W., Hess, D., ...
  • Lee, T.-Y., Huang, H.-D., Hung, J.-H., Huang, H.-Y., Yang, Y.-S., ...
  • Lee, T. Y., Hsu, J. B. K. Lin, F. M., ...
  • Li, H., Xing, X., Ding, G., Li, Q., Wang, C., ...
  • Lothrop, A. P., Torres, M. P., & Fuchs, S. M. ...
  • Macek, B., Gnad, F., Soufi, B., Kumar, C., Olsen, J. ...
  • Martin, L., Latypova, X., & Terro, F. (2011). Post-tra nslationa ...
  • Micel, L. N., Tentler, J. J., Smith, P. G., _ ...
  • Miletich, J., & Broze, G. (1990). Beta protein _ is ...
  • Minguez, P., Parca, L., Diella, F., Mende, D. R., Kumar, ...
  • Mishra, G. R., Suresh, M., Kumaran, K., Kannabiran, N., Suresh, ...
  • Peri, S., Navarro, J. D., Amanchy, R., Kristiansen, T. Z., ...
  • Pilobello, K. T., & Mahal, L. K. (2007). Deciphering the ...
  • Prasad, T. K., Goel, R., Kandasamy, K., Keerthikumar, S., Kumar, ...
  • Radivojac, P., Vacic, V., Haynes, C., Cocklin, R. R., Mohan, ...
  • Rice, J. C., & Allis, C. D. (2001). Histone methylation ...
  • Shubassi, G., Robert, T., Vanoli, F., Minucci, S., & Foiani, ...
  • Silberstein, S., & Gilmore, R. (1996). Biochemistry, molecular biology, and ...
  • Skamnaki, V., Owen, D., Noble, M., Lowe, E., Lowe, G., ...
  • Van Damme, P., Arnesen, T., & Gevaert, K. (2011). Protein ...
  • Vidali, G., Gershey, E., & Allfrey, V. (1968). Chemical Studies ...
  • Von Der Lieth, C.-W., Bohne-Lang, A., Lohmann, K. K., & ...
  • Wilson, I, Gavel, Y., & Von Heijne, G. (1991). Amino ...
  • Wojcik, J., _ Schachter, V. (2000). Proteomic databases and software ...
  • Wu, C. H. (1997). Artificial neural networks for molecular sequence ...
  • Xie, B., Invernizzi, C. F., Richard, S., & Wainberg, M. ...
  • Xu, Y., Wang, X., Wang, Y., Tian, Y., Shao, X., ...
  • Yang, X.-J., & Seto, E. (2008). Lysine acetylation: codified crosstalk ...
  • Yin, D., Gavi, S., Shumay, E., Duell, K., Konopka, J. ...
  • Zanzoni, A., Ausiello, G., Via, A., Gherardini, P. F., & ...
  • Zhang, H., Zha, X., Tan, Y., Hornbeck, P. V., Mastrangelo, ...
  • Zhao, M., Zhang, Z., Mai, G., Luo, Y., & Zhou, ...
  • Zielinska, D. F., Gnad, F., Wisniewski, J. R., & Mann, ...
  • نمایش کامل مراجع