مقایسه الگوی بیان ژن های دو ژنوتیپ حساس و متحمل به شوری برنج با استفاده از داده های میکرواری
سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 751
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0854
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
شوری یکی از چالش های در حال گسترش برای تولید گیاهان زراعی است . تنش شوری سبب تغییر الگوی بیان بسیاری از ژن های درگیر در مسیرهای بیوشیمیایی مختلف می شود . این پژوهش به منظور بررسی تغییرات الگوی بیان ژنها در شرایط تنش شوری در برگ ژنوتیپهای خساس و متحمل به شوری برنج انجام شد. داده های بیکرواری در دو شرایط کنترل و تنش شوری از پایگاه داده NCBI گرفته شدند . نتایج نشان داده که به ترتیب 2314 و 1489 ژن پس از تنش شوری د ربرگ ژنوتیپ های حساس و متحمل تغییر بیان معنی داری داشتند . از این تداد بیان 750 ژن در نوتیپ حساس و 226 ژن در ژنوتیپ متحمل افزایش معنی داری نشان دادند . دیاگرام ون نشان داد که 71 ژن دارای افزایش بیان و 455 ژن دارای کاهش بیان بین دوژنوتیپ مشترک بودند . گروه بندی کارکردهای ژن های دارای افزایش بیان در دو ژنوتیپ مشخص کرد که در ژنوتیپ متحمل به شوری گروه های کارکردی پیام رسانی، پروتئینهای ذخره های و پاسخ به تنش دارای بیشترین تعداد ژن ها بودند در حالیکه در ژنوتیپ حساس به شوری، گروه های کارکردی metal-binding و اکسیدوریداکتاز ژن های بیشتری در خود جای دادند .
نویسندگان
کتایون حمیدی
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات ، بخش زراعت و اصلاح نباتات ، دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
هومن راضی
استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتات ، دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
احمد طهماسبی
دانشجوی دکتری اصلاح نباتات بخش زراعت و اصلاح نباتات ، دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :