بررسی تغییر بیان miRNA ها وشناسایی ژن های هدف آنها در گیاه برنج درپاسخ به تنش خشکی

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,016

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI08_0755

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

چکیده مقاله:

اmiRNAها، از اعضای مهم RNA های کوچک تنظیمی هستند که در فرآیندهای مختلف بیولوژیکی و متابولیکی گیاه نقش دارند. miRNA ها باتنظیم حساس و دقیق ژن ها در مسیرهای شناخته شده و مهم گیاهان امکان پاسخ مناسب گیاه به تغییرات مراحل رشدی یا شرایط محیطی را فراهم می کنند. این مطالعه به منظور شناسایی miRNA های دخیل در پاسخ گیاه برنج به شرایط تنش خشکی انجام شد. درمجموع 79 miRNA کاهش بیان و 9 miRNA افزایش بیان را نشان دادند و به ترتیب 277 و 8 ژن هدف بالقوه برای این miRNA ها شناسایی شد. بسیاری از miRNA های شناسایی شده درتنظیم بیان ژن های کد کننده فاکتور های رونویسی نقش دارند. مهم ترین miRNA هایی که تغییر بیان نشان دادند، عبارت بودند از miR159، miR164 ، miR166 ، miR167 ، miR171 و miR444 که به ترتیب در تنظیم بیان اعضای مختلفی از ژن های کدکننده فاکتورهای رونویسی MYB ، NAC ، HD-ZIP ، ARF ، SC و MADS نقش دارند. همچنین در این مطالعه 25 miRNA جدید در برنج شناسایی شدند. این نتایج درک بهتری از نقش miRNA ها در پاسخ گیاه در مواجه با تنش ارائه داده و نشان داد که miRNA ها نقش مهمی را به عنوان فاکتور کلیدی درکنترل پاسخ برنج به تنش خشکی ایفا می کنند.

کلیدواژه ها:

برنج ، تنش خشکی ، توالی یابی با کارایی بالا ، miRNA

نویسندگان

احسان محسنی فرد

دانشجوی دکتری دانشگاه فردوسی مشهد

محمد فارسی

هیات علمی دانشگاه فردوسی مشهد

امین میرشمسی کاخکی

هیات علمی دانشگاه فردوسی مشهد

بهنام بخشی

دانشجوی دکتری دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • هسنمین همابس ببو نکنولوزی جم‌هوری اسلامی ابران _ چهارمین همابس ...
  • Bartel, D.P., MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function. Cell, 2004. ...
  • Khraiwesh, B., J.-K. Zhu, and J. Zhu, Role of miRNAs ...
  • Wang, T., et al., Identification of drought- responsive microRNAs in ...
  • Zhu, Q.-H., et al., A diverse set of microRNAs and ...
  • Xue, L.-J., J.-J. Zhang, and H.-W. Xue, Cha racterization and ...
  • Xin, M., et al., Diverse Set of microRNAs care responsive ...
  • Li, T., et al., Identification and analysis of seven H2 ...
  • Wang, T., et al., Identification of drought- responsive microRNAs in ...
  • Dubos, C., et al., MYB transcriptiont factors in Arabidopsis. Trends ...
  • Soderman, E., et al., The HD-Zip gene ATHB6 in Arabidopsis ...
  • Hai, L.A., et al., Four AUXIN RESPONSE FACTOR genes downregulated ...
  • Curaba, J., et al., Ove r-expressiont of microRNA17 affects phase ...
  • Yamaguchi, T. and H.-Y. Hirano, Function and diversification of MADS-box ...
  • Trindade, I., et al., miR398 and miR408 care up-regulated in ...
  • Kantar, M., S.J. Lucas, and H. Budak, miRNA expression patterns ...
  • نمایش کامل مراجع