مقایسه مولکولی میگوی ببری سبز خلیج فارس ( Penaeus semisulcatus ) و زیر گونه آن: تفاوت قابل توجه براساس COI 16 و یکسانی توالی ها بر اساس S rRNA

میگوی ببری سبز Penaeus semisulcatus یکی از مهم ترین گونه های جنس پنئوس در خلیج فارس است. براساس خصوصیات ریختی، زیر گونه جدیدی از میگوی ببری سبز با نام P.semisulcatus persicus معرفی شده است. مقایسه مولکولی اولیه میان گونه و زیر گونه بر اساس 16 S rRNA نشان از تفاوت قابل توجه میان این دو بود. این نتیجه، مطالعه بیش تر با سایر نشانگرهای مولکولی را مورد تاکید قرار می دهد. لذا زیر واحد ژنومی استخراج شده از پاهای شنای میگو DNA . مورد توجه قرار گرفت (COI) یک سیتوکروم اکسیداز به ترتیب با استفاده از آغازگرهای COI 16 و S rRNA به عنوان الگو استفاده شد. سپس قطعه ای از ژن تکثیر و از هر دوطرف تعیین توالی شد. همردیفی توالی ها با استفاده از COIa/COIf 16 و Sar/16Sbr جهانی به COI 16 و S rRNA انجام شد. نتایج حاصل از تعیین توالی نشان داد که قطعه تکثیر شده ژن Clustalw هستند . نتیجه همردیفی توالی ها نشان داد ک ه ترادف AT ترتیب 561 و 681 جفت باز طول دارد و غنی از 16 گونه از هر دو ناحیه دقیقا با هم مطابقت دارند. هم ین نتیجه برا ی زیرگونه ن ی ز S rRNA نوکلئوتیدی ژن 16 از گونه و زیر گونه مذکور نشان داد که 18 جانشینی بازی در این دو S rRNA مشاهده شد. همردیفی توالی 3 محاسبه شد. فاصله ژنتیکی گونه و زیر گونه با استفاده از / رخ داده است. نسبت ترانزیشن به ترانسورژن هم 906 گونه و زیرگونه است ( COI %3/3 محاسبه شد. نکته قابل تامل، تطابق کامل توالی ،MEGA نرم افزار 5.05 16S rRNA ب یش تر از ژن COI فاصله ژنتیکی 00 % )، در صورتی که در تحقیقات مشابه، تفاوت ها در ژن گزارش شده است. این نتیجه لزوم استفاده از سایر نشانگرهای مولکولی را بیش از پیش مورد تاکید قرار می دهد.

کلیدواژه ها:

خلیج فارس ، زیر واحد 1 ، Penaeus semisulcatus ، P.semisilcatus persicus ، 16S rRNA ، سیتوکروم اکسیداز