تشخیص آنتاگونیست های برتر باکتری Erwinia amylovora از طریق آنالیز توالی ژن 16S rDNA

سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 527

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI07_0041

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

چکیده مقاله:

هدف از این تحقیق، جداسازی باکتریهای اپیفیت از شکوفه، برگ و شاخه درختان سالم و آلوده دانه دار و هسته دار باغهای کرج، اصفهان و نیشابور و بررسی خاصیت آنتاگونیستی آنها علیه E. Amylovora در شرایط آزمایشگاهی بود. بدین منظور، از دو آزمون آنتی بیوز و میوه نارس استفاده شد. از میان 120 جدایه باکتری جدا شده، 21 جدایه در هر دو آزمون قابلیت بازدارندگی از رشد باکتری عامل بیماری را داشتند. این جدایه ها شامل جنس های ،Serratia ،Pantoea ،Pseudomonas، Enterobacter و Bacillus بودند. از بین آنها، 4 جدایه که دارای بیشترین میزان بازدارندگی در سطح پتری و میوه نارس، رشد زیاد در سطح محیط کشت و پایداری در بازدارندگی بودند، به عنوان آنتاگونیست برتر انتخاب و از طریق آنالیز توالی ژن S rDNA 16 شناسایی شدند. بدین منظور پس از استخراج DNA، ژن rDNA 16S با استفاده از پرایمرهای P6/P0 تکثیر و باندی به اندازه 1500 جفت باز را ایجاد نمودند. قطعات حاصل به روش اتوماتیک در هر دو جهت سنس و آنتی سنس در کمپانی (Macrogen, Korea) تعیین توالی شدند. پس از همردیف کردن توالی ها با سایر توالی های مربوط به این نواحی در گونه های مختلف باکتری موجود در بانک ژن مشخص شد که با شباهت 99% جدایه E10 متعلق به گونه P. fluorescens، جدایه Abp2 به P. agglomerans، جدایه E11 به P. putida و جدایه Kgh1 متعلق به باکتری S. marcescens است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

الهه گرامی

گروه بیماری شناسی گیاهی، واحد علوم و تحقیقات دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران

نادر حسن زاده

موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر گیاهی شناسی

ابوالقاسم قاسمی

موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، بخش بیماری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Altschul, S. F., Gish, W., Miller, W., Myers, E. W. ...
  • Beer, S. V. and Rondle. . R. 1983. Suppression of ...
  • Buban, T., Lakatos, T., Toth, T., Dorgai, L. and Hevesi, ...
  • Chen, K. H. Neimark, P. Rumore, and C. R. Steinman. ...
  • Davoodi, A., A. Ghasemi. 2010. Evaluation of Bac-MasterTN (Streptomycin) in ...
  • Julien, M. and Lindow, S. E. 2001. Field Performance of ...
  • Klement, Z., G. L. Farkas and L. Loverkovich 1974. Hypersensitive ...
  • Lindow, S. E., Mc.Gourty, G. and Elkins, R. 1996. Interactions ...
  • Manceau, C., Gardan, F. and Paulin, J. P. 1987. Use ...
  • PICARD, C., F. DI CELLO, M. VENTURA and R. FANI. ...
  • RADEMAK R, J.L.W. and DE BRUIJN, F.J. 1997. C haracterization ...
  • Relman, D. A. 1999. The search for unrecognized pathogens. Science ...
  • Schaad N. W., J. B. Jones and W. Chun. 2001. ...
  • Schoofs, H., Vandebroek, k., Pierrard, A., Thonart. P., Lepoiver, P., ...
  • نمایش کامل مراجع