ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید
CIVILICAWe Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

COMPARISION OF GBLUP AND CGBLUP POWER OF QTL DETECTION USING THEIR MARKER ESTIMATED EFFECTS

تعداد صفحات: 2 | تعداد نمایش خلاصه: 368 | نظرات: 0
سال انتشار: 1392
کد COI مقاله: NIAC01_244
زبان مقاله: انگلیسی
نسخه کامل مقاله در کنفرانس ارائه نشده است و در دسترس نیست.

مشخصات نویسندگان مقاله COMPARISION OF GBLUP AND CGBLUP POWER OF QTL DETECTION USING THEIR MARKER ESTIMATED EFFECTS

Abbas Jahan Bakhshi - Department of Animal Science, Varamin-Pishva Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

چکیده مقاله:

Since the early work of Meuwissen et al. (2001), researchers have proposed different methods of computing genomic breeding values (GBLUP). Those models are most often based on the simultaneous estimation of SNP marker effects a (Gianola et al., 2006). Jahan Bakhshi (2013) proposed a chromosomal genomic model (CGBLUP) in which animal records can be incorporated for separate chromosomal models. Chromosomal models used for making a multivariate analysis that can benefit numerator relationship matrix directly for chromosomal level. However overall estimated marker effects were used primarily for estimating individuals BV but this marker effect used for QTL detection. The objective of this study was comparison of marker effects estimated by conventional GBLUP and CGBLUP for power of QTL detection on genome.MATERIAL AND METHODS Stochastic simulation was used in this study. Simulation includes two steps like Meuwissen et al. (2001). A procedure as Jahan Bakhshi (2013) was used to simulate a genome consisting 500 bi-allelic genes and 10000 biallelic markers evenly distributed on 10 chromosomes and average linkage disequilibrium of r2=0.2 as a source population. Population size increased to 100000 dams and 500 active sires. Gene effect were sampled from a normal distribution to meet desired trait parameters. Pseudo records were simulated by adding an error component (prediction error) to true breeding values according to , in which is reliability of estimated breeding values of sires (CEBV). Two methods GBLUP (Model 1) and CGBLUP model (2) were used to estimate marker effects. Gaus Sidel Iteration with 10-5 convergence criteria was used to estimate marker effects. in order to prepare statistical comparison, marker effects were standardized for average and standard deviation of all estimated effects of related model. For all of the QTLs with weak, intermediate and high contribution of traits variance, number of markers meet estimation of over 3 were considerably superior for CGBLUP. Results indicate that CGBLUP can detect QTLs more efficiently than GBLUP.

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/340367/

کد COI مقاله: NIAC01_244

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Jahan Bakhshi, Abbas,1392,COMPARISION OF GBLUP AND CGBLUP POWER OF QTL DETECTION USING THEIR MARKER ESTIMATED EFFECTS,اولین کنفرانس بین المللی ایده های نو در کشاورزی,اصفهان,,,https://civilica.com/doc/340367

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1392, Jahan Bakhshi, Abbas؛ )
برای بار دوم به بعد: (1392, Jahan Bakhshi؛ )
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود ممقالهقاله لینک شده اند :

  • Gianola, D., R. L. Fernando and A. Stella. 2006. Genomic ...
  • Jahan Bakhshi A., 2013, Incorporating Chroosomt Numerator Relationship Matrix in ...
  • Meuwisen, T. H. E., B. J. Hayes, and M. E. ...
  • مدیریت اطلاعات پژوهشی

    صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله

    اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    علم سنجی و رتبه بندی مقاله

    مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
    نوع مرکز: دانشگاه آزاد
    تعداد مقالات: 1,700
    در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

    مقالات مرتبط جدید

    به اشتراک گذاری این صفحه

    اطلاعات بیشتر درباره COI

    COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

    کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

    پشتیبانی